针对风电项目非法占用土地被没收地上建筑物后的处理方式，需结合土地管理法、城乡规划法及相关政策综合判断，具体处理路径如下：

1. 行政机关的后续处置程序

根据《土地管理法》第七十七条及《城乡规划法》第六十八条，非法占用土地建设的建筑物被没收后，行政机关（通常为自然资源部门或综合执法部门）需履行以下程序：

• 权属登记：将没收的建筑物登记至政府名下（如财政部门或指定机构），完成物权转移；
• 用途规划：根据土地利用总体规划和城乡规划，决定没收建筑物的后续用途：
  • 拆除情形：若建筑物违反规划且无法补救（如占用永久基本农田、生态保护红线等），行政机关可依法拆除并恢复土地原状；
  • 保留利用情形：若建筑物符合规划或经整改后可合法使用（如符合产业政策的风电配套设施），可由政府通过招标、拍卖等方式公开处置，或直接划拨给符合条件的主体（如原项目方补办手续后继续使用）。

2. 原项目方的权利救济与责任承担

• 行政处罚后的补救：若原项目方希望继续使用建筑物，需在行政处罚决定生效后，向自然资源部门申请补办用地手续（如农用地转用审批、供地手续），并缴纳罚款及土地出让金；
• 损失分担规则：根据《民法典》第一百五十七条，若建筑物被没收导致原项目方损失，需区分过错责任：
  • 若因政府审批疏漏导致非法占地（如未严格审查用地预审），原项目方可主张行政赔偿；
  • 若因项目方故意隐瞒或伪造材料导致非法占地，需自行承担损失，且可能面临刑事责任（如非法占用农用地罪）。

3. 第三方权益保护机制

• 承包经营权人补偿：若被占用土地为集体所有，且原项目方与村集体签订了土地承包或租赁合同，村集体可依据《农村土地承包法》第五十六条，要求原项目方赔偿因合同无效导致的损失（如租金损失、土地复垦费用）；
• 抵押权人优先受偿：若建筑物已设定抵押，抵押权人（如银行）可依据《民法典》第三百八十六条，在政府处置建筑物时主张优先受偿权，但需以建筑物评估价值为限。

4. 特殊情形处理：风电项目的政策倾斜

根据《关于促进新时代新能源高质量发展的实施方案》（国办发〔2022〕16号），对符合条件的存量风电项目，政府可采取“一事一议”方式处理非法占地问题：

• 整改达标后补办手续：若项目已并网发电且社会效益显著，行政机关可责令限期整改（如补办用地预审、环评手续），整改完成后不予没收建筑物；
• 协议收回与置换：政府可与原项目方协商，通过收回原非法占地并置换其他合规地块的方式，保障项目继续运营。

建议行动：若您涉及此类案件，需立即委托律师介入，重点审查以下材料：

1. 土地审批文件（如用地预审意见、供地合同）；
2. 建筑物建设规划许可；
3. 行政处罚决定书及执行文书；
4. 项目社会效益评估报告（如发电量、碳减排数据）。

如有进一步疑问，可直接向我咨询，我将结合具体案情提供详细方案。