结论前置：行政法规本身不能直接设定限制人身自由的措施，但行政机关在特定法律授权和法定程序下，可以依据法律对公民的人身自由进行限制。这种限制必须严格依法进行，确保有明确的法律依据并遵循法定程序，同时充分保障公民的合法权益不受侵犯。
行政法规与限制人身自由的关系
行政法规的设定权限：
- 根据《中华人民共和国立法法》及相关法律规定，行政法规的制定权限主要限于执行法律的规定需要制定行政法规的事项，以及宪法第八十九条规定的国务院行政管理职权的事项。然而，限制公民人身自由的行政强制措施，只能由法律设定，行政法规无权设定。这意味着，行政法规本身不能直接规定限制人身自由的措施，如行政拘留等。
行政机关的限制人身自由权：
- 尽管行政法规不能直接设定限制人身自由的措施，但行政机关在特定法律授权下，可以依法对公民的人身自由进行限制。这种限制通常基于维护社会治安、公共安全、公共卫生等公共利益的需要，且必须严格遵循法定程序和条件。
行政机关限制人身自由的常见情形及法律依据
行政拘留：
- 法律依据：《中华人民共和国治安管理处罚法》等法律规定了行政拘留的适用条件与程序。
- 适用情形：对于违反治安管理规定或其他行政法律规范的行为人，公安机关可依法处以行政拘留，期限一般为一日以上十五日以下，合并执行最长不超过二十日。行政拘留是对违反治安管理行为人短期剥夺其人身自由的制裁方法。
强制传唤与继续盘问：
- 法律依据：《中华人民共和国治安管理处罚法》第八十二条及《公安机关适用继续盘问规定》。
- 适用情形：适用于违反治安管理相关规定需接受调查但无正当理由不配合的情况，或人民警察在执行职务活动中发现有违法犯罪嫌疑的人员。对被盘问人的留置时间自带至公安机关之时起不超过二十四小时，在特殊情况下，经县级以上公安机关批准，可以延长至四十八小时。
强制约束：
- 法律依据：《中华人民共和国治安管理处罚法》第十五条。
- 适用情形：针对醉酒后可能危害自身或他人安全的人员，公安机关有权采取保护性措施约束至酒醒。
强制隔离戒毒：
- 法律依据：《中华人民共和国禁毒法》。
- 适用情形：对于吸毒成瘾且符合特定情节的人员，如拒绝接受社区戒毒、在社区戒毒期间吸食毒品等，公安机关可决定强制隔离戒毒。
传染病防治中的隔离措施：
- 法律依据：传染病防治相关法律法规。
- 适用情形：在传染病暴发、流行时，为控制传播，行政机关可对疑似或确诊患者进行隔离治疗或医学观察。
行政机关限制人身自由应遵循的原则
- 合法性原则：任何限制人身自由的措施都必须有明确的法律依据，并符合法律规定的条件和程序。
- 比例性原则：采取措施时应考虑必要性、适当性和合理性，避免过度干预公民权益。
- 保障人权原则：在限制人身自由过程中，应充分保障被限制人的基本权利和自由，如知情权、申辩权、申诉权等。
- 程序正当原则：遵循法定程序和要求，确保程序的公正性和透明度。
总结与建议
行政机关在限制人身自由时，必须严格遵守法律法规规定的条件和程序，确保行政行为的合法性和合理性。公民也应了解并遵守相关法律法规，维护自身合法权益和社会秩序。如果您对行政机关限制人身自由的具体情形或程序有疑问，或认为自己的合法权益受到侵犯，欢迎直接向我咨询，我将根据您的具体情况提供详细的法律建议。