结论：在人口普查时，若妈妈已离世，且爸爸的亲子鉴定结果显示与孩子非亲生，孩子能否上户需视具体情况而定，但通常可以通过合法途径解决上户问题。

详细分析：

1. 亲子鉴定非亲生的法律意义：

   • 亲子鉴定结果若显示非亲生，从生物学角度上确认了爸爸与孩子之间不存在直接的遗传关系。但这并不直接决定孩子能否上户，因为上户问题更多涉及的是法律上的亲子关系和户籍管理规定。

2. 上户的法律依据与流程：

   • 根据我国户籍管理规定，孩子上户通常需要提供出生证明、父母双方的身份证、结婚证（如已婚）等相关材料。若父母未结婚或一方已离世，则需提供其他相关证明材料。
   • 在本案例中，妈妈已离世，爸爸亲子鉴定非亲生，这并不意味着孩子无法上户。关键在于能否提供其他证明孩子与爸爸之间法律上亲子关系的材料，或者通过其他合法途径解决上户问题。

3. 可能的解决方案：

   • 提供其他亲子关系证明：若爸爸与孩子之间存在法律上的亲子关系（如收养关系、继父子关系等），则需提供相应的证明材料，如收养证明、法院判决书等。
   • 通过法律程序确认亲子关系：若爸爸对亲子关系有异议，且认为孩子应与其上户，可以通过法律程序（如提起亲子关系确认诉讼）来确认亲子关系。若法院最终确认爸爸与孩子之间存在法律上的亲子关系，则孩子可以上户。
   • 遵循户籍管理部门的指导：在实际操作中，户籍管理部门可能会根据具体情况提供指导或要求提供额外的证明材料。因此，建议咨询当地户籍管理部门，了解具体的上户要求和流程。

4. 特殊情况下的处理：

   • 若孩子确实无法与爸爸上户，且妈妈已离世，孩子可能需要通过其他亲属（如祖父母、外祖父母等）或法定监护人来办理上户手续。这同样需要提供相应的证明材料和遵循户籍管理规定。

建议：

• 鉴于每个家庭的具体情况不同，且户籍管理规定可能因地区而异，建议直接咨询当地户籍管理部门或寻求专业律师的帮助，以获取最准确、最具体的指导。
• 在处理此类问题时，务必保持冷静和理性，遵循法律程序和规定，以维护孩子的合法权益。

如有任何法律疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供详细的法律建议。