关于自然人异地代开发票是否违法的问题，这主要取决于具体的操作是否符合相关税收和发票管理的法规。
首先，我们需要明确的是，代开发票本身是一个合法的行为，但必须由税务机关根据收款方（或提供劳务服务方）的申请，并依照法规、规章以及其他规范性文件的规定来代为开具。这是为了强化税源监控，更好地维护市场经济秩序。
对于自然人异地代开发票的情况，关键在于是否符合以下条件：
申请代开的合法性：自然人必须是因为临时取得收入，且依法需要开具发票，才能向税务机关申请代开。这包括但不限于未办理税务登记的单位和个人临时取得收入，或者已办理税务登记但因特殊原因（如发票被收缴、业务量小等）需要税务机关代开的情况。
异地经营的合规性：如果自然人是在异地临时从事经营活动，原则上应当按照《税务登记管理办法》的规定，持《外出经营活动税收管理证明》向经营地税务机关办理报验登记，并领取发票自行开具。只有在业务量小、开票频度低的情况下，才可以申请经营地税务机关代开。
代开发票的流程和要求：申请代开发票的自然人需要填写代开普通发票申请表，并提供相关证明材料，如合法身份证件和付款方对所购物品品名、单价、金额等出具的书面确认证明。税务机关在核对这些资料一致后，才会予以代开，并加盖税务机关代开发票专用章。
如果自然人异地代开发票的行为不符合上述条件，特别是未经税务机关合法代开而自行跨规定区域开具发票，那么这种行为就是违法的。根据《中华人民共和国发票管理办法》的规定，跨规定区域开具发票的，由税务机关责令改正，并可以处1万元以下的罚款；有违法所得的，还会予以没收。
因此，我建议自然人在需要异地代开发票时，一定要先了解并遵守相关的税收和发票管理法规，确保自己的行为合法合规。如果有任何疑问或不确定的地方，最好咨询当地税务机关或专业的税务顾问以获取准确的指导和帮助。