厂家与医药公司之间的挂靠行为，在大多数情况下是不合法的，且存在较大的法律风险。以下从不同角度对此问题进行详细分析：
一、挂靠行为的法律定性
挂靠行为通常指的是一个不具备特定资质或条件的主体，通过与具备相应资质或条件的主体建立形式上的关联，以该具备资质或条件的主体的名义从事经营活动。在医药领域，这种挂靠行为往往涉及药品的生产、销售等环节，可能违反《药品管理法》、《反不正当竞争法》以及《刑法》等相关法律法规。
违反《药品管理法》：
- 根据《药品管理法》的规定，药品的生产、经营必须取得相应的许可证，并严格按照许可证的范围进行。挂靠行为可能使得不具备药品生产或经营资质的主体得以绕过这一法定要求，从而非法从事药品生产或经营活动，这是被严格禁止的。
违反《反不正当竞争法》：
- 挂靠行为可能构成不正当竞争，因为它通过不正当手段获取了市场优势地位，损害了其他合法经营者的利益。例如，挂靠方可能利用被挂靠方的品牌、信誉等资源，以较低的成本进入市场，从而对其他经营者构成不公平竞争。
可能涉及刑事犯罪：
- 在某些情况下，挂靠行为还可能涉及刑事犯罪，如生产、销售假药罪、非法经营罪等。如果挂靠方生产的药品存在质量问题，或者挂靠行为本身就违反了国家对药品管理的强制性规定，那么相关责任人员可能面临刑事追究。
二、挂靠行为的法律后果
行政处罚：
- 对于违反《药品管理法》等法律法规的挂靠行为，药品监督管理部门有权对相关责任主体进行行政处罚，包括罚款、没收违法所得、吊销许可证等。
民事赔偿：
- 如果挂靠行为给消费者或其他经营者造成了损失，相关责任主体还可能面临民事赔偿的责任。例如，因挂靠方生产的药品质量问题导致消费者受损的，消费者有权要求挂靠方和被挂靠方承担连带赔偿责任。
刑事责任：
- 如前所述，在严重情况下，挂靠行为可能构成刑事犯罪，相关责任人员将面临刑事追究和相应的刑罚。
三、合法合规的建议
避免挂靠行为：
- 厂家和医药公司应严格遵守国家法律法规，避免任何形式的挂靠行为。如果确实需要合作，应通过合法合规的方式进行，如建立正式的合作关系、签订合作协议等。
加强内部管理：
- 厂家和医药公司应加强内部管理，确保自身的经营活动符合法律法规的要求。这包括建立健全的质量管理体系、加强员工培训、定期进行自查自纠等。
寻求法律帮助：
- 如果对挂靠行为的合法性存在疑问或面临相关法律风险，建议及时咨询专业律师的意见。律师可以根据具体情况提供针对性的法律建议和解决方案。
综上所述，厂家与医药公司之间的挂靠行为在大多数情况下是不合法的，且存在较大的法律风险。因此，建议双方严格遵守国家法律法规，避免任何形式的挂靠行为，并通过合法合规的方式进行合作。如果有任何法律问题或疑虑，可以直接向我咨询。