结论：项目金额低于5万元的公开竞争项目若设置限制性条款，是否会受到处罚，这主要取决于限制性条款的具体内容及其合法性。若限制性条款违反了相关法律法规或公平竞争原则，则可能会受到处罚；反之，若条款合法合规，则通常不会受到处罚。
分析说明：
限制性条款的合法性：
- 公开竞争项目中的限制性条款，必须遵守国家法律法规，不得违反公平竞争原则。例如，若条款设置不合理地排除了某些潜在投标者，或者对特定投标者给予不公平的优惠，这样的条款就可能被视为违法。
- 具体来说，如果限制性条款涉及歧视性待遇、不公平竞争、串通投标等违法行为，那么根据《中华人民共和国招标投标法》等相关法律法规，相关责任方可能会受到行政处罚，包括罚款、没收违法所得、责令停业整顿等。
项目金额与处罚的关系：
- 项目金额的大小，并不是决定是否会受到处罚的唯一因素。即使项目金额低于5万元，如果限制性条款违法，同样可能受到处罚。
- 处罚的严重程度，通常与违法行为的性质、情节以及造成的后果等因素有关。因此，不能单纯以项目金额来判断是否会受到处罚。
实际操作中的建议：
- 在设置公开竞争项目的限制性条款时，应确保条款的合法性和合规性，避免违反相关法律法规和公平竞争原则。
- 如果对限制性条款的合法性存在疑问，建议咨询专业律师或相关监管机构，以确保条款的合法性和有效性。
后续行动建议：
- 如果您是项目发起方或组织者，在设置限制性条款前，应仔细审查条款内容，确保其合法合规。
- 如果您是潜在投标者，发现项目中的限制性条款存在违法或不合理之处，可以向相关监管机构举报或投诉，以维护自己的合法权益。
- 在任何情况下，如果您对限制性条款的合法性或相关法律问题存在疑问，都可以直接向我咨询，我将根据您的具体情况提供专业的法律意见。