关于合作关系下农用车出意外，车主是否应赔偿的问题，这并非一个简单的“是”或“否”的答案，而是需要根据具体情况来综合判断。以下是我从不同角度为您进行的分析：

1. 合作关系性质与责任划分

   • 如果合作关系中明确约定了双方对于农用车使用、管理、维护等方面的责任和义务，那么当农用车发生意外时，应首先依据合作协议中的条款来确定责任归属。若协议中规定车主需承担特定责任，则车主应按约赔偿。
   • 若合作协议未明确约定或约定不明确，那么就需要根据《民法典》中关于合伙合同、委托合同等相关规定，以及公平原则、过错原则等法律原则来综合判断车主是否应承担赔偿责任。

2. 车主的过错程度

   • 如果车主在农用车的使用、管理、维护等方面存在过错，如未定期检修车辆、未确保车辆符合安全标准、未对驾驶员进行必要的安全教育等，且这些过错直接导致了意外的发生，那么车主应承担相应的赔偿责任。
   • 如果车主已尽到合理的注意义务，且意外是由于不可抗力、第三方原因或驾驶员个人行为等不可归责于车主的因素导致的，那么车主可能不承担赔偿责任或仅承担部分赔偿责任。

3. 农用车使用情况与责任

   • 如果农用车是在执行合作事务过程中发生意外的，且该事务属于合作协议约定的范围，那么车主作为合作方之一，可能需要根据合作协议的约定或法律规定来承担一定的赔偿责任。
   • 如果农用车是在非合作事务过程中发生意外的，如驾驶员私自用车、用于个人目的等，那么车主的责任可能会相对减轻或免除，除非车主对驾驶员的私自用车行为存在过错或明知而未制止。

4. 保险情况与赔偿

   • 如果农用车已购买相关保险，如交强险、商业险等，那么在意外发生后，应首先由保险公司按照保险合同的约定进行赔偿。车主的赔偿责任可能会因保险赔偿而部分或全部免除。
   • 如果农用车未购买保险或保险赔偿不足，那么车主可能需要根据上述分析的责任划分来承担剩余的赔偿责任。

建议：

• 在处理此类纠纷时，建议首先收集并保存好所有相关证据，如合作协议、车辆检修记录、驾驶员资质证明、意外现场照片、警方调查报告等。
• 尝试与对方进行协商，寻求和解或调解解决纠纷。如果协商无果，可以考虑通过法律途径解决，如向法院提起诉讼或申请仲裁。
• 在整个过程中，建议咨询专业律师的意见，以确保您的权益得到充分保障。

最后，需要强调的是，每个案件都有其独特的事实和法律背景，因此上述分析仅供参考。如果您或您身边的人遇到了类似的问题，欢迎直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供更详细、更专业的法律建议。