当男方希望进行亲子鉴定而女方不同意时，这个问题确实需要细致且谨慎地处理。以下是我为您提供的详细解答：
一、沟通协商是首要步骤
尝试坦诚沟通：男方应首先与女方进行深入的、坦诚的对话，了解她拒绝做亲子鉴定的具体原因。这可能涉及到隐私担忧、对鉴定过程的误解，或者是对亲子关系的其他顾虑。通过沟通，双方可以增进理解，并尝试找到一个双方都能接受的解决方案。
寻求第三方调解：如果直接沟通没有结果，男方可以考虑邀请一个中立的第三方，如亲友、社区工作者或专业的调解机构，来协助双方进行沟通和协商。调解员可以帮助双方更清晰地表达自己的观点，并寻找共同的利益点。
二、法律途径是可选方案
提起诉讼：如果沟通协商无果，且男方有充分的理由怀疑孩子的亲生关系（例如，存在抚养权、抚养费等争议），他可以向人民法院提起诉讼，请求确认亲子关系。在诉讼过程中，法院会根据双方提供的证据和情况，决定是否需要进行亲子鉴定。
申请强制鉴定：根据相关法律规定，如果男方提供了必要证据来支持其主张，而女方没有相反证据且拒绝做亲子鉴定，法院在特定情况下有权裁定强制进行亲子鉴定。但这一决定会非常谨慎地作出，以确保不侵犯女方的隐私和正当权益。
考虑其他证据：除了亲子鉴定外，男方还可以收集其他相关证据来支持自己的主张，如孩子的出生证明、医疗记录、证人证言等。这些证据可能在法院缺乏亲子鉴定结果的情况下，对判断亲子关系起到辅助作用。
三、注意事项需牢记
尊重女方意愿：在整个过程中，男方应始终尊重女方的意愿和隐私权。亲子鉴定是一个敏感的话题，涉及个人隐私和家庭关系，因此应谨慎处理。
合法合规行事：无论采取何种方式解决问题，男方都应确保自己的行为合法合规，避免侵犯他人的合法权益或个人隐私。
考虑孩子感受：在处理此类问题时，男方还应充分考虑孩子的感受和利益。亲子关系的确认或否认可能对孩子产生深远的影响，因此应尽量避免对其造成不必要的伤害。
综上所述，当女方不同意做亲子鉴定时，男方应首先尝试通过沟通协商来解决问题。如果沟通无果，且男方有充分的理由和证据支持其主张，他可以考虑通过法律途径来寻求解决方案。但无论如何，都应尊重女方的意愿和隐私权，并确保整个过程的合法合规性。