无效的协议，法院会依据相关法律规定确认其无效，并据此作出判决。以下是对此问题的详细分析：

一. 协议无效的情形

1. 违反法律法规的强制性规定：根据《民法典》第一百五十三条，违反法律、行政法规的强制性规定的民事法律行为无效。若协议内容违反法律法规的强制性规定，如涉及非法交易、侵犯他人合法权益等，该协议将被认定为无效。

2. 违背公序良俗：同样根据《民法典》第一百五十三条，违背公序良俗的民事法律行为也无效。若协议内容违背社会公共利益、道德风尚或公共秩序，如涉及赌博、嫖娼等违法行为，该协议同样无效。

3. 行为人与相对人恶意串通，损害他人合法权益：根据《民法典》第一百五十四条，行为人与相对人恶意串通，损害他人合法权益的民事法律行为无效。若协议是双方恶意串通的结果，且损害了第三人的合法权益，该协议也将被认定为无效。

二. 法院对无效协议的处理

1. 确认无效：法院在审理过程中，若发现协议存在上述无效情形，将依法确认该协议无效。

2. 处理后果：协议被确认无效后，法院将根据具体情况处理后续事宜。例如，对于因协议取得的财产，应当予以返还；不能返还或者没有必要返还的，应当折价补偿。有过错的一方应当赔偿对方由此所受到的损失；各方都有过错的，应当各自承担相应的责任。

• 生活实例：假设甲乙双方签订了一份涉及非法交易的协议，后该协议被法院认定为无效。法院将判决该协议无效，并要求双方返还因协议取得的财产，同时根据过错程度判决双方承担相应的赔偿责任。

三. 我的观点

我认为，在签订协议时，双方应当严格遵守法律法规和公序良俗，确保协议内容的合法性和有效性。若协议被法院认定为无效，不仅可能导致双方无法实现预期目的，还可能因此承担不必要的法律责任和经济损失。因此，建议在签订协议前，务必咨询专业律师，对协议内容进行全面审查和把关。

如有进一步需要，您可以继续咨询我。