针对您提出的“股东出资未备注怎么认定投资款，以及相关法院案例”的问题，这是一个涉及公司法、合同法及证据规则等多个法律领域的复杂问题。以下我将结合一般法律原则和可能的司法实践，为您详细解答。

一、投资款认定的核心依据及未备注情况下的处理

在认定股东对公司的投资款时，我们通常会依据以下几个核心要素：

1. 合同约定与公司章程：

   • 投资协议或公司章程中明确规定了股东的出资方式、金额、时间等关键信息。这些文件是认定投资款的首要依据。
   • 若出资时未备注“投资款”，但合同或章程中有明确约定，且其他证据（如转账记录、收款收据等）能佐证该款项为投资款，则仍可认定。

2. 资金支付凭证：

   • 银行转账记录是证明资金流动的重要证据。即使未备注“投资款”，若转账记录中的付款人、收款人、转账金额及时间与合同或章程中的约定相符，且能排除其他合理怀疑（如借款、还款等），则该款项仍可能被认定为投资款。
   • 收款收据需由公司出具，并加盖财务章或公章。若收据上明确注明了收款事由为“投资款”，则即使转账时未备注，也不影响投资款的认定。

3. 公司财务记录：

   • 公司的会计凭证和财务报表应准确记录投资款的来源、金额及会计科目。若财务记录中明确将该款项列为“实收资本”或“股本”等，则即使转账时未备注，也不影响其作为投资款的性质。

4. 工商登记信息：

   • 工商登记中的注册资本登记及股权变更登记信息是官方认可的投资款及股权变动证据。若股东已按约定出资，并完成了工商登记变更，则即使转账时未备注，也不影响其股东身份和出资额的认定。

二、未备注投资款的法院案例及司法实践

在司法实践中，对于股东出资未备注“投资款”的情况，法院通常会结合上述核心要素进行综合判断。以下是一个可能的案例分析：

案例概述： 股东A向公司B转账一笔款项，但转账时未备注“投资款”。后双方因出资问题产生纠纷，股东A主张该款项为投资款，要求确认其股东身份和出资额。公司B则主张该款项为借款或其他性质，拒绝确认股东A的出资。

法院审理： 法院在审理此案时，会首先审查投资协议或公司章程中是否有关于股东出资的明确约定。若存在约定，且股东A的转账记录、收款收据、公司财务记录及工商登记信息等证据能相互印证，形成完整的证据链，证明该款项确实为投资款，则法院会支持股东A的诉求。

判决结果： 若法院认定该款项为投资款，则会判决确认股东A的股东身份和出资额，并要求公司B办理相应的工商登记变更手续。若法院无法认定该款项为投资款，则可能会驳回股东A的诉求。

三、建议

1. 完善合同和章程：在签订投资协议或制定公司章程时，应明确约定股东的出资方式、金额、时间等关键信息，并要求股东在转账时备注“投资款”以强化证明力。

2. 保留完整证据：股东应妥善保留转账记录、收款收据、公司财务记录等证据，以备不时之需。

3. 咨询专业律师：在涉及出资纠纷时，建议咨询专业律师以确保合规性和准确性，从而维护自身合法权益。

综上所述，股东出资未备注“投资款”并不必然导致无法认定其出资性质。在司法实践中，法院会结合合同约定、资金支付凭证、公司财务记录及工商登记信息等多方面因素进行综合判断。因此，股东在出资时应尽量完善相关手续和证据，以降低纠纷风险。