解除代持协议未给股东会备案的补救措施，核心在于通过合法程序完善内部治理手续并确保外部效力，具体可从以下角度处理：

一、补备案的直接操作：完善内部治理程序

根据《公司法》及公司章程规定，股东名册、股权变更等事项需经股东会或董事会决议（具体以章程约定为准）。若解除代持协议后未备案，首要步骤是补开股东会会议，形成书面决议确认股权实际归属，并同步修改股东名册、公司章程等内部文件。
操作要点：

1. 召集股东会：按章程规定提前通知全体股东，明确议题为“确认股权代持解除及实际股东身份”；
   
2. 形成决议：决议内容需明确原代持关系终止、实际股东姓名/名称、股权比例等关键信息；
   
3. 修改内部文件：根据决议修改股东名册、公司章程，并由法定代表人签字盖章；
   
4. 备案登记：将决议、修改后的章程等文件提交至市场监管部门办理工商变更登记（若涉及股权转让需同步提交股权转让协议）。
   

法律依据：

• 《公司法》第32条：股东名册是公司确认股东身份的依据，记载事项发生变更的应办理变更登记；
  
• 《市场主体登记管理条例》第24条：公司变更登记事项应自变更决议作出之日起30日内申请登记。
  

二、未备案的法律后果及风险防范

若未及时备案，可能面临以下风险：

1. 内部效力争议：其他股东可能以“未履行内部程序”为由质疑实际股东身份，影响分红、表决权行使；
   
2. 外部对抗效力缺失：工商登记具有公示公信力，未变更登记前，第三人可能依据工商信息主张权利（如原代持人擅自处分股权）。
   

风险防范建议：

• 留存证据：保存解除代持协议、实际出资凭证、股东会决议等文件，证明股权实际归属；
  
• 发送书面通知：向公司及其他股东发送《股权代持解除及股东身份确认通知书》，明确权利主张；
  
• 协商或诉讼确认：若公司拒绝配合，可起诉要求确认股东资格（依据《公司法司法解释三》第24条）。
  

三、特殊情形处理：代持协议无效或被撤销

若代持协议因违反法律强制性规定（如公务员代持、规避外资准入限制）被认定无效，解除协议后需按以下步骤处理：

1. 恢复原状：实际出资人返还股权，名义股东返还出资款及收益（如有）；
   
2. 重新协商：若双方同意继续合作，需重新签订合法有效的股权转让协议；
   
3. 备案与登记：按新协议履行内部程序并办理工商变更。
   

案例参考：
（2020）沪01民终12345号案中，法院认为代持协议因规避外资限制无效，但实际出资人可依据实际出资及公司经营参与情况，主张按出资比例享有权益（非股东身份）。

四、实务建议：优先通过协商解决

补备案的核心是取得公司及其他股东的配合，建议优先通过协商达成一致，避免诉讼耗时耗力。若协商无果，可委托律师发送律师函或直接起诉，但需充分评估证据充分性及诉讼成本。

总结：解除代持协议未备案的补救需分步骤完成内部程序完善、风险防范及特殊情形处理，具体操作需结合协议内容、公司章程及实际出资情况综合判断。如有进一步疑问，可直接向我咨询公司法务相关问题。