关于道路运输管理条例对客运超员的处罚，结论前置如下：
客运超员是严重的交通违法行为，根据《中华人民共和国道路交通安全法》及相关实施条例，将依据超员的严重程度受到相应的罚款、记分、扣留机动车及至吊销相关证件等处罚。以下是对客运超员处罚的详细分析：
一、行政处罚
罚款：
- 根据《中华人民共和国道路交通安全法》第九十二条，公路客运车辆载客超过额定乘员的，处二百元以上五百元以下罚款。
- 若超载达到核定人数20%但未达50%，罚款金额可能提升至五百元以上二千元以下；若超载达到核定人数50%以上，罚款金额同样可达二千元。
记分与扣留机动车：
- 驾驶公路客运车辆载人超过核定人数未达20%的，一次记6分。
- 驾驶公路客运汽车载人超过核定人数20%以上的，一次记12分，并可能由公安机关交通管理部门扣留机动车至违法状态消除。这意味着，在超员20%以上的情况下，驾驶人的驾驶证将被记满12分，需要参加为期七日的道路交通安全法律、法规和相关知识学习，并在二十日内进行道路驾驶技能考试。
驾驶证降级或吊销：
- 对于持有大型客车、牵引车等准驾车型驾驶证的驾驶人，在一个记分周期内有记满12分记录的，车辆管理所应当注销其最高准驾车型驾驶资格。
- 若因超员导致重大交通事故，构成犯罪的，依法追究刑事责任，并由公安机关交通管理部门吊销机动车驾驶证。
其他行政措施：
- 交通运输部门可对违规企业采取通报批评、责令整改等措施。
- 对多次违法的企业和个人，可列入重点监管名单，实施联合惩戒。
二、特殊规定与严重后果
运输单位责任：
- 若运输单位的车辆存在超员情形，且经处罚不改，对直接负责的主管人员处二千元以上五千元以下罚款。
- 对于运输单位车辆一年内因超员被处罚两次以上的，还将面临吊销道路运输经营许可证的处罚。
刑事责任：
- 根据《刑法修正案（九）》，营运客车严重超员可能构成危险驾驶罪，相关责任人将面临刑事追责。
- 若因超员导致重大交通事故，构成犯罪的（如交通肇事罪），依法追究刑事责任。根据《中华人民共和国刑法》，违反交通运输管理法规发生重大事故致人重伤、死亡或使公私财产遭受重大损失的，处三年以下有期徒刑或拘役；情节特别恶劣的，处三年以上七年以下有期徒刑。
民事赔偿责任：
- 超员行为导致乘客伤亡的，承运人需承担损害赔偿责任。赔偿范围包括医疗费、误工费、护理费及残疾赔偿金等。
三、超员的危害性
- 行车安全：超员增加车辆不稳定性，延长制动距离，提升爆胎、失控等风险。
- 紧急救援：在交通事故等紧急情况下，超员会极大阻碍乘客逃生和救援工作。
- 潜在隐患：超员客车常伴随超速行驶、夜间行驶等违法行为，进一步加剧安全隐患。
总结与建议：
客运超员是严重的交通违法行为，其危害不容小觑。法律对此设定了严格的处罚措施，旨在维护道路交通秩序和保护公众安全。作为乘客，应坚决拒绝乘坐超员车辆，积极举报违法行为；作为驾驶员和运输单位，更应严格遵守法律法规，确保行车安全，共同营造一个安全、有序的道路交通环境。若您有任何关于交通事故或保险理赔的法律问题，欢迎直接向我咨询。