工程招投标备案资料甲方的保存期限，主要依据项目的性质和类型来确定，具体如下：

1. 依法必须进行招标的项目：

   • 根据《中华人民共和国招标投标法实施条例》的相关规定，依法必须进行招标项目的相关资料，包括招标文件、投标文件以及中标通知书等所有与招标活动相关的文件，保存期限至少为合同履行完毕后10年。这意味着，对于这类项目，甲方作为招标人，需要确保这些资料在合同履行完毕后的至少10年内得到妥善保存。

2. 政府采购项目：

   • 对于政府采购项目，招、投标文件的保存期限要求更为严格，至少为15年。这是为了确保招标过程的透明性和可追溯性，从而保障各方当事人的合法权益。因此，如果工程招投标项目属于政府采购范畴，甲方需要按照这一要求保存相关资料。

3. 工程招投标项目（非政府采购）：

   • 对于非政府采购的工程招投标项目，虽然法律法规没有统一明确规定具体的保存期限，但通常建议保存期限为20年。这是由于工程项目涉及较大的资金投入和较长的建设周期，需要更长时间的资料保存以备查阅和审计。甲方作为招标人，可以参照这一建议来设定自己的资料保存期限。

4. 其他注意事项：

   • 无论项目性质如何，甲方在保存招投标备案资料时，都应确保资料的详细、完整，并不得擅自损毁。在保存期限内，任何单位和个人都不得擅自处理存档备查的资料。若资料达到保存期限需要销毁，必须依法进行处理。
   • 甲方还应建立科学的档案管理制度，配置适宜的库房和设施、设备，以确保档案的安全。同时，采用先进技术实现档案管理的现代化，以便对招标资料进行高效、便捷的管理和利用。

法律建议：

• 甲方在保存工程招投标备案资料时，应严格遵守相关法律法规的规定，确保资料的完整性和安全性。
• 如果甲方对资料保存期限有疑问或需要更具体的指导，建议咨询专业的法律人士或相关机构，以确保合规操作。

可能法律后果：

• 若甲方未按照规定保存招标资料或擅自损毁存档备查的资料，将可能承担相应的法律责任，包括但不限于警告、罚款等处罚措施。因此，甲方应高度重视资料保存工作，避免不必要的法律风险。

如有其他疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。