结论前置：代位追偿中全责方不认可定损金额时，保险公司仍可先行修车，但需通过合法程序固定损失证据，后续可能需通过协商、鉴定或诉讼解决争议。具体分析如下：

一、保险公司有权先行修车的法律依据

根据《保险法》第六十条及《机动车交通事故责任强制保险条例》第二十八条，保险公司自向被保险人赔偿保险金之日起，即取得代位行使被保险人对第三者请求赔偿的权利。定损金额的争议不影响保险公司履行修车义务，原因如下：

1. 合同履行优先性：保险公司与被保险人之间的保险合同已明确约定修车责任，定损仅是确定赔偿金额的环节，非修车前提条件；
2. 损失固定必要性：若车辆长期不修可能导致损失扩大（如零部件进一步损坏），保险公司需通过及时修车防止损失不合理增加；
3. 证据保全义务：保险公司可通过修车前留存照片、视频、维修清单等证据，证明实际损失与定损金额的关联性。

二、全责方不认可定损的解决路径

若全责方（即侵权方）对定损金额提出异议，保险公司需通过以下程序完善证据链：

1. 协商补充定损：
   • 保险公司可与全责方共同委托第三方公估机构重新定损；
   • 双方需签署《定损协议书》，明确认可公估结果作为赔偿依据。
2. 司法鉴定程序：
   • 若协商无果，保险公司或全责方可向法院申请司法鉴定，由法院委托具备资质的鉴定机构出具《损失评估报告》；
   • 鉴定费用通常由败诉方承担，但需以法院判决为准。
3. 诉讼直接主张：
   • 保险公司可凭修车发票、维修清单、定损报告等证据，直接向法院起诉全责方及（如涉及）其保险公司；
   • 法院将根据证据规则审查定损合理性，并判决赔偿金额。

三、实务风险提示

1. 修车费用合理性：
   • 保险公司需确保修车项目与事故直接相关，避免将非事故损失纳入赔偿范围；
   • 若全责方能证明修车费用存在虚高（如更换非必要零部件），可能被法院核减赔偿金额。
2. 证据留存完整性：
   • 修车前需对车辆损伤部位进行全方位记录（包括4S店或维修厂出具的《预检单》）；
   • 修车后需保留更换下来的旧件（如涉及重大部件更换），以备全责方质证。
3. 诉讼时效限制：
   • 代位追偿诉讼时效为3年，自保险公司实际赔偿被保险人之日起计算，需及时主张权利。

建议：若您作为被保险人面临此类纠纷，可要求保险公司出具完整的定损报告及修车依据；若作为全责方，可主动要求参与定损过程或申请司法鉴定，避免后续争议。如有进一步问题，可直接向我咨询具体操作流程。