关于违纪款和违法款是“一起收”还是“分开收”的问题，这主要取决于具体的法律规定、行政机关的执法程序以及款项的性质，不能一概而论。以下从几个角度进行分析：

1. 款项性质与法律规定：

   • 违纪款通常指的是违反单位内部规章制度或纪律规定所应缴纳的款项，其性质更偏向于内部管理范畴。
   • 违法款则是指因违反国家法律法规而应缴纳的罚款、罚金等，具有更强的法律强制性。
   • 从法律层面讲，违纪款和违法款在性质、收取主体、收取程序等方面均存在显著差异。因此，在大多数情况下，它们不会由同一机关在同一程序中一并收取。

2. 执法程序与主体：

   • 违纪款的收取通常由单位内部纪律检查部门或相关管理部门负责，依据单位内部的规章制度进行。
   • 违法款的收取则由具有执法权的行政机关或司法机关负责，如公安机关、法院等，依据国家法律法规进行。
   • 由于执法程序和主体的不同，违纪款和违法款在收取时通常会分开进行，以确保程序的合法性和公正性。

3. 实际操作中的考虑：

   • 在某些特定情况下，如单位内部人员同时存在违纪和违法行为，且违纪行为与违法行为存在关联时，可能会在同一调查或处理过程中同时涉及违纪款和违法款的收取。但即便如此，这两部分款项在收取时仍会明确区分，并分别按照相应的程序和标准进行。
   • 此外，如果违纪款和违法款分别由不同的机关或部门负责收取，那么它们自然会分开收取，不会混淆。

法律建议：

• 对于个人或单位而言，如果面临违纪款和违法款的收取问题，应首先明确款项的性质和收取主体，了解相关的法律规定和执法程序。
• 如果对款项的收取存在疑问或争议，可以及时向相关机关或部门咨询或申诉，以维护自己的合法权益。
• 在任何情况下，都应积极配合相关机关或部门的调查和处理工作，如实提供相关信息和证据，以便问题得到妥善解决。

总结来说，违纪款和违法款在收取时通常会分开进行，以确保程序的合法性和公正性。如果面临相关问题，建议明确款项性质、了解法律规定和执法程序，并积极配合相关机关或部门的工作。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。