若发现个体工商户营业执照住改商过程中存在全体业主签字虚假的情况，可采取以下处理措施：

1. 向相关部门举报

   • 依据《个体工商户条例》及相关地方性法规，住改商需经有利害关系的业主同意。若发现签字虚假，可向当地市场监督管理部门或工商行政管理部门举报。
     
   • 举报时需提供虚假签字的证据（如签字样本比对、业主声明等），相关部门将展开调查，若查实，可能撤销该营业执照或责令整改。

2. 通过法律途径维权

   • 行政诉讼：若市场监督管理部门未依法处理，可提起行政诉讼，要求法院撤销其作出的行政许可（如营业执照核发）。
     
   • 民事诉讼：受影响的业主可起诉个体工商户或相关责任人，主张其签字行为侵犯相邻权或构成欺诈，要求停止侵害、赔偿损失。
     
   • 刑事举报：若虚假签字涉及伪造公文、印章等行为，可能触犯《刑法》第二百八十条（伪造公司、企业、事业单位、人民团体印章罪），可向公安机关报案。

3. 要求重新征求业主意见

   • 在行政程序或诉讼中，可主张原签字程序违法，要求市场监督管理部门重新组织业主表决，确保住改商符合法定条件。

注意事项：

• 证据收集是关键，需保留签字原件、业主联系方式、沟通记录等，必要时可申请笔迹鉴定。
  
• 若涉及物业或业委会，可要求其协助核实业主真实意愿。
  
• 处理过程中需遵守法定程序，避免因维权方式不当承担法律责任。
  

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