公司转股东投资款收个人所得税是否合法，需分情况讨论：
若股东投资款被视为股息、红利等投资性收益：
- 根据《中华人民共和国个人所得税法》的相关规定，个人取得股息、红利等投资性收益，属于个人所得税的征税范围。因此，如果公司转给股东的投资款被税务机关认定为股息、红利等投资性收益，那么公司代扣代缴个人所得税是合法的。这种情况下，公司作为扣缴义务人，有义务按照税法规定代扣代缴股东应缴纳的个人所得税。
若股东投资款被视为资本返还或减资：
- 如果公司转给股东的投资款实际上是对股东原始出资的返还，或者是因为公司减资而退还给股东的款项，那么这部分款项通常不被视为应税收入，因此不需要缴纳个人所得税。但需要注意的是，公司减资需要遵循公司法规定的程序，包括编制资产负债表及财产清单、通知债权人并公告等，否则可能面临法律风险。
若存在其他特殊情况：
- 在某些特殊情况下，如股东与公司之间存在借款关系，且公司转给股东的款项被视为偿还借款，那么这部分款项也不属于应税收入，不需要缴纳个人所得税。但同样需要注意，股东与公司之间的借款关系需要合法合规，避免被认定为抽逃出资等违法行为。
法律建议：
- 对于公司而言，在转给股东投资款时，应明确款项的性质和目的，并遵循相关税法规定代扣代缴个人所得税（如适用）。同时，公司应确保所有财务操作合法合规，避免因操作不当而引发法律风险。
- 对于股东而言，在收到公司转来的投资款时，应了解款项的性质和税务处理方式。如果对税务处理有疑问或不确定，建议及时咨询专业税务人士或律师，以确保自身权益不受损害。
可能后果：
- 如果公司未按照税法规定代扣代缴个人所得税，或者股东未依法申报缴纳个人所得税，可能面临税务机关的处罚，包括补缴税款、加收滞纳金以及罚款等。
- 如果公司转给股东的投资款被认定为抽逃出资等违法行为，公司及其股东可能面临更严重的法律后果，包括但不限于罚款、限制股东权利、甚至撤销公司登记等。
如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。