替别人还企业负债1000万抵押款这一行为本身并不违法，但具体是否合法合规，需结合多种因素综合判断。以下从不同角度为你详细分析：

一、行为性质分析

1. 代为清偿债务的合法性

   • 根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，债务人以外的第三人（如你）可以代为清偿债务，只要这种清偿行为不损害债务人、债权人或其他第三人的利益，且不违反法律、行政法规的强制性规定或公序良俗。
   • 在你替别人还企业负债1000万抵押款的情况下，若该企业同意你代为清偿，且债权人（如银行或其他金融机构）也接受你的清偿，那么这一行为在法律上是允许的。

2. 抵押权的处理

   • 抵押权是债权人为了担保债务的履行而设定的权利，当债务得到清偿时，抵押权通常随之消灭。
   • 在你代为清偿债务后，应确保抵押权得到妥善处理，如办理抵押权的注销登记等，以避免后续的法律纠纷。

二、潜在风险与注意事项

1. 债务的真实性与合法性

   • 在代为清偿债务前，务必核实债务的真实性和合法性。确保该债务确实存在，且没有违反法律、行政法规的强制性规定或公序良俗。
   • 若债务存在争议或违法情况，你代为清偿可能会卷入不必要的法律纠纷。

2. 资金来源的合法性

   • 确保你用于代为清偿债务的资金来源合法，没有涉及洗钱、非法集资等违法活动。
   • 若资金来源存在问题，你可能会面临法律责任。

3. 合同条款的审查

   • 在代为清偿债务前，应仔细审查相关合同条款，特别是关于代为清偿的约定、抵押权的处理等。
   • 确保合同条款明确、合法，且没有损害你的合法权益。

4. 后续权益的保障

   • 若你代为清偿债务后，希望向债务人追偿，应在代为清偿前与债务人签订书面协议，明确追偿的权利和方式。
   • 同时，保留好相关证据，如转账记录、清偿证明等，以便在需要时维护自己的合法权益。

三、法律建议

1. 咨询专业律师：在代为清偿债务前，建议咨询专业律师，对债务的真实性、合法性、合同条款等进行全面审查，并获取专业的法律意见。
2. 签订书面协议：与债务人签订书面协议，明确代为清偿的金额、方式、时间以及追偿的权利和方式等。
3. 保留证据：保留好所有与代为清偿债务相关的证据，如转账记录、清偿证明、合同协议等。

总结来说，替别人还企业负债1000万抵押款这一行为本身并不违法，但需确保债务的真实性与合法性、资金来源的合法性、合同条款的明确性以及后续权益的保障。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。