针对您提出的“有证林地被别人占了找哪个部门申诉”的问题，以下是我的详细解答：
一、主要申诉部门及其职责
林业部门（林业局）：
- 作为主管林业资源的部门，林业局有权对林地的使用、保护等情况进行监管。当您的有证林地被他人侵占时，您可以首先向林业局反映情况。林业局会展开调查，核实侵占行为，并根据情节轻重给予相应的行政处罚，如责令停止违法行为、恢复植被、罚款等。
自然资源部门：
- 自然资源部门负责土地资源的统一管理，包括林地。如果侵占行为涉及土地规划、用途管制等方面的问题，自然资源部门也可以从土地管理的角度介入调查，并依法处理违法占地问题。
公安机关（含森林公安）：
- 在林地被侵占行为达到一定严重程度，涉嫌构成犯罪时（如非法占用农用地罪），公安机关会依法进行刑事侦查，追究犯罪嫌疑人的刑事责任。森林公安在林业领域具有专门的执法权，可以处理涉及林地的刑事案件。
当地政府（乡镇人民政府或街道办事处）：
- 作为基层政府组织，乡镇人民政府或街道办事处对辖区内的各类事务有综合管理职责。您可以向当地政府反映情况，请求其协调相关部门处理林地侵占问题。
检察部门：
- 如果林地侵占行为损害了公共利益，或相关行政部门存在不作为等情况，您可以向检察院反映。检察院可以通过提起公益诉讼等方式来维护林地权益和公共利益。
二、申诉材料准备
在向相关部门申诉时，您应准备充分的材料以支持自己的诉求，包括但不限于：
- 您的身份证明和林地使用权证明（如有证林地证书）；
- 侵占行为发生的时间、地点、过程及与侵占者协商的情况；
- 有关证据（如照片、视频、合同、协议等）来证明非法占用林地的行为；
- 明确、具体地提出诉求，如要求恢复原状、赔偿损失等。
三、法律建议
及时申诉：一旦发现林地被侵占，应尽快向相关部门申诉，以免错过最佳处理时机。
保留证据：在申诉过程中，务必妥善保留所有相关证据，以便在需要时提供证明。
寻求法律援助：如果申诉过程中遇到困难或不确定如何处理，可以寻求专业律师的法律援助。
综上所述，当您的有证林地被别人侵占时，您可以通过向林业部门、自然资源部门、公安机关、当地政府或检察部门申诉来维护自己的权益。同时，准备好充分的申诉材料也是成功维权的关键。如果您有任何法律问题或需要进一步的法律建议，请随时向我咨询。