土地承包经营权证的注销和撤销确实存在区别。以下是对这两者的详细解析：

一、注销

注销，通常指的是在土地使用权因某种原因消灭或终止后，由相关行政机关依法定程序，将原土地使用权在登记簿上予以注销的行为。这主要基于《土地管理法》及相关法规的规定，旨在确保土地管理秩序和土地的合理合法利用。注销土地证涉及土地使用权的撤销与登记程序的终止，必须由县级以上人民政府批准，土地管理部门负责具体执行。注销的情形包括但不限于：

• 非法批准与占用土地；
• 土地权利因自然灾害等原因灭失；
• 国有土地使用权出让或租赁期限届满未续期；
• 他项权利终止等。

注销土地登记的具体程序包括提交申请、审核材料、批准与注销以及公告与通知等环节。注销后，土地原有的权利状态消灭，原土地权利人不再享有任何土地相关权利。

二、撤销

撤销，则更多地指的是行政机关或司法机关对之前作出的行政行为或法律文书进行否定，使其失去法律效力的行为。在土地承包经营权证的语境下，撤销可能指的是因某种原因（如违法、错误等）导致土地承包经营权证被相关行政机关或司法机关撤销，从而使其失去法律效力。

撤销与注销的主要区别在于：

• 性质不同：注销是土地使用权因某种原因自然消灭或终止后的登记行为，而撤销是对之前行政行为或法律文书的否定。
• 原因不同：注销的原因多样，包括土地使用权期满、土地权利灭失等；而撤销通常是因为之前的行政行为或法律文书存在违法、错误等情形。
• 程序不同：注销需要按照法定程序进行申请、审核、批准等；而撤销可能需要通过行政复议、行政诉讼等法律程序进行。

综上所述，土地承包经营权证的注销和撤销在性质、原因和程序等方面均存在明显区别。在实际操作中，应严格根据相关法律法规和程序要求进行处理，以确保土地管理秩序的规范性和土地权利的合法性。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。