作废土地经营权证与注销土地经营权证在法律效果上存在显著差异。

一. 作废土地经营权证

1. 定义与性质：作废通常指的是因某种原因（如证件错误、过期、失效等）使土地经营权证失去法律效力，但这一行为可能并不涉及官方登记簿的变更。作废更多是一种单方面的声明或行为，不一定需要经过官方程序。
2. 法律效果：作废后，土地经营权证在法律上不再具有证明效力，但土地经营权的实际状态可能并未因此发生改变，除非同时进行了相应的官方登记或变更。

• 例如，某人因土地经营权证上的信息错误而自行作废该证，但这并不意味着其土地经营权就此消失，只是该证件不再作为有效证明。

二. 注销土地经营权证

1. 定义与性质：注销则是一种官方的、正式的行为，通常涉及官方登记簿的变更。当土地经营权因转让、终止、收回等原因不再存在时，需要进行注销登记。
2. 法律效果：注销后，不仅土地经营权证失去法律效力，而且官方登记簿上的相应记录也会被更改或删除。这意味着土地经营权的实际状态已经发生了改变，且这一改变得到了官方的确认和记录。
3. 法律依据：根据《农村土地承包经营权证管理办法》等相关法律法规，注销土地经营权证需要按照法定程序进行，并涉及官方登记簿的变更。

• 例如，当某人将土地经营权转让给他人后，原土地经营权证就需要进行注销登记，以反映土地经营权的实际变更情况。

总结：作废土地经营权证主要是使证件失去法律效力，但不一定涉及官方登记簿的变更；而注销土地经营权证则是一种官方的、正式的行为，不仅使证件失效，还涉及官方登记簿的相应变更。因此，在实际操作中，应根据具体情况选择适当的处理方式，并确保符合相关法律法规的要求。如有进一步需要，您可以继续咨询我。