结论前置：关于“约定董事会超过三人同意方可通过，3个人就不行”这一问题，不能简单断定3个人同意就一定不行，这取决于董事会总人数以及具体约定内容。以下从不同角度进行分析：

一、从董事会决议通过比例的角度分析

1. 若董事会总人数为3人，且约定“超过三人同意方可通过”：

   • 在这种情况下，由于董事会总人数就是3人，不存在“超过三人”的情况，因此该约定在逻辑上存在问题，无法直接适用。若严格按照字面意思理解，则任何决议都无法通过，因为无法满足“超过三人同意”的条件。但这种情况显然不符合公司治理的常规逻辑，实际中可能会通过修改公司章程或相关协议来明确决议通过的具体人数或比例。

2. 若董事会总人数大于3人，且约定“超过三人同意方可通过”：

   • 在这种情况下，决议的通过需要满足“超过三人同意”的条件。如果只有3人同意，则未达到“超过三人”的标准，因此决议不能通过。例如，董事会总人数为5人，约定“超过三人同意方可通过”，则至少需要4人同意决议才能通过。

二、从公司章程和协议约定的角度分析

1. 公司章程或协议有明确约定：

   • 如果公司章程或相关协议中明确规定了董事会决议的通过比例或人数，且该约定不违反法律法规的强制性规定，则应按照约定执行。在这种情况下，“超过三人同意方可通过”的约定是有效的，但具体适用还需结合董事会总人数来判断。

2. 公司章程或协议无明确约定或约定不明确：

   • 如果公司章程或相关协议中没有明确规定董事会决议的通过比例或人数，或者约定不明确，则应按照《公司法》等相关法律法规的规定执行。根据《公司法》的规定，董事会决议的表决，实行一人一票，董事会作出决议，必须经全体董事的过半数通过（但公司章程另有规定的除外）。因此，在缺乏明确约定的情况下，应依据法律法规的规定来确定决议的通过条件。

三、法律建议

1. 明确约定：

   • 为了避免争议和纠纷，建议在制定公司章程或相关协议时，明确规定董事会决议的通过比例或人数。这样可以在实际操作中提供明确的指导，减少不必要的法律风险。

2. 遵守法律法规：

   • 在制定公司章程或相关协议时，应确保约定内容不违反法律法规的强制性规定。如果约定内容与法律法规相冲突，则该约定无效，可能引发法律纠纷。

3. 及时咨询专业律师：

   • 如果在制定公司章程或相关协议过程中遇到法律问题或疑问，建议及时咨询专业律师。律师可以根据具体情况提供专业的法律意见和建议，帮助公司制定合法合规的章程和协议。

总结来说，对于“约定董事会超过三人同意方可通过，3个人就不行”的问题，不能一概而论。需要结合董事会总人数以及具体约定内容来判断决议是否能够通过。在实际操作中，建议明确约定决议通过的比例或人数，并遵守相关法律法规的规定。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。