校长在不知情的情况下，一般不直接承担食堂主擅自套取学生餐费用用于食堂其他支出的法律责任，但可能因管理失职承担一定的行政责任或内部管理责任。以下从不同角度进行分析：
一、法律责任角度
刑事责任：
- 食堂主擅自套取学生餐费用，若数额较大，可能构成贪污罪或职务侵占罪（具体取决于食堂主的身份和资金性质）。但校长若不知情，且未参与或指使该行为，则不构成共同犯罪，不承担刑事责任。
民事责任：
- 校长作为学校的管理者，若因管理不善导致学生餐费用被套取，可能因管理失职被追究一定的民事责任，但这种责任通常是间接的，且需要证明校长存在过错。在大多数情况下，校长不会直接承担食堂主套取费用的赔偿责任，除非能够证明校长与食堂主存在共同故意或过失。
行政责任：
- 校长作为学校的主要负责人，若因管理不善导致学校财产受损，可能面临教育行政部门的行政处罚，如警告、记过、降级、撤职等。这种责任是基于校长对学校的管理职责，而非直接对套取费用的行为负责。
二、管理责任角度
内部管理责任：
- 校长作为学校的管理者，有责任确保学校财务的透明和合规。若食堂主擅自套取学生餐费用，校长可能因未履行好管理职责而受到学校内部或上级教育行政部门的问责。这种问责可能包括批评教育、责令整改、扣发奖金等。
声誉损失：
- 校长作为学校的代表，其管理下的学校发生此类事件，可能对学校的声誉造成负面影响。校长可能需要采取措施来挽回学校声誉，如公开道歉、加强内部管理、接受媒体采访等。
三、建议与措施
加强内部管理：
- 校长应加强对学校财务的监管，确保每一笔费用都合规使用。可以建立严格的财务审批制度，定期对学校财务进行审计，防止类似事件再次发生。
及时报告与处理：
- 若发现食堂主擅自套取学生餐费用，校长应立即向上级教育行政部门报告，并配合相关部门进行调查处理。同时，校长应采取措施保护学生权益，如退还套取的费用、改善学生餐质量等。
加强法律意识教育：
- 校长应加强对学校教职工的法律意识教育，提高他们对法律法规的遵守意识。可以定期组织法律培训活动，让教职工了解相关法律法规和学校规章制度。
若您或学校遇到此类问题，或有其他法律疑问，可以直接向我咨询。我将根据您的具体情况，提供专业的法律建议和帮助。