员工提起诉讼时，公司是否会出具盖章的证明，取决于证明的性质、用途以及公司的配合程度，不能一概而论。以下从不同角度进行分析：
一、证明的性质与用途
与案件直接相关的证明：
- 如果员工提起的诉讼涉及公司行为（如工伤赔偿、劳动合同纠纷等），且需要公司出具与案件直接相关的证明（如工资单、考勤记录、工伤认定书等），公司有义务根据法律规定或法院要求提供。
- 在这种情况下，公司通常会出具盖章的证明，以作为案件审理的证据。如果公司拒绝提供，员工可以申请法院责令公司出具，或者依据其他证据进行证明。
与案件无直接关联的证明：
- 如果员工要求的证明与案件无直接关联（如个人品行证明、无犯罪记录证明等），公司可能没有义务出具，或者需要员工提供合理的理由和依据。
- 在这种情况下，公司是否出具盖章的证明，将取决于公司的内部政策和规定，以及员工与公司的协商结果。
二、公司的配合程度
积极配合：
- 如果公司愿意积极配合员工提起的诉讼，可能会主动出具盖章的证明，以协助员工维护合法权益。
- 这种情况下，员工通常能够顺利获得所需的证明文件。
消极应对或拒绝：
- 如果公司对员工提起的诉讼持消极态度，或者拒绝出具盖章的证明，员工可能需要通过法律途径来强制公司履行义务。
- 例如，员工可以申请法院责令公司出具证明，或者依据其他证据进行证明。如果公司因拒绝出具证明而给员工造成损失，还可能承担赔偿责任。
三、法律建议与后果
法律建议：
- 员工在提起诉讼前，应尽可能收集与案件相关的证据，包括公司出具的证明文件。
- 如果公司拒绝出具证明，员工可以与公司协商，或者向劳动监察部门投诉、申请劳动仲裁等。
- 在必要时，员工还可以依法向人民法院提起诉讼，要求公司履行出具证明的义务或承担赔偿责任。
可能的法律后果：
- 如果公司因拒绝出具证明而给员工造成损失，根据《中华人民共和国劳动合同法》等相关法律规定，公司可能承担赔偿责任。
- 同时，公司还可能面临劳动行政部门的责令改正等行政处罚。
举例说明：假设员工因工伤赔偿问题提起诉讼，需要公司提供工伤认定书作为证据。如果公司拒绝出具，员工可以申请法院责令公司出具，或者依据其他医疗记录、证人证言等证据进行证明。如果因公司拒绝出具证明而导致员工无法获得应有的赔偿，公司可能承担赔偿责任。
总结与建议：员工在提起诉讼时，应尽可能与公司协商获取所需的盖章证明。如果公司拒绝配合，员工可以通过法律途径来维护自己的合法权益。如有具体法律问题或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。