结论：合同中约定逾期利息及违约金为万分之五，法院是否支持需结合具体情况判断，包括合同约定是否合法明确、实际损失情况、违约金性质及是否存在法定调整情形等。以下从不同角度详细分析：

一、法律原则与违约金性质

根据《中华人民共和国民法典》第五百八十五条，当事人可约定一方违约时支付违约金，或约定损失赔偿额的计算方法。违约金具有补偿性为主、惩罚性为辅的性质，其核心功能是弥补守约方因违约遭受的损失。若合同中约定的逾期利息及违约金（万分之五）未超出实际损失范围，且符合公平原则，法院通常予以支持。

举例：
若借款合同中约定“逾期还款按日万分之五计收违约金”，且借款人逾期导致出借人产生资金占用损失（如银行同期贷款利率损失），该违约金未明显高于实际损失，法院可能支持。

二、法院支持违约金的常见情形

1. 约定明确且合法
   合同中清晰约定了逾期利息及违约金的计算方式（如日万分之五），且不违反法律法规强制性规定（如未超过法定利率上限）。
   法律依据：《民法典》第五百八十五条。
   举例：
   工程合同中约定“工期延误按日万分之五支付违约金”，若该比例符合行业惯例，法院可能认可其合理性。

2. 实际损失可证明
   守约方能提供证据证明因违约遭受的实际损失（如财务报表、第三方评估报告），且违约金未明显超过合理范围。
   举例：
   买卖合同中卖方延迟交货导致买方错失商机，买方提供利润损失证据后，法院可能支持按日万分之五计算的违约金。

3. 违约金具有补偿性
   若违约金与实际损失相当，法院倾向于维持约定。例如，租赁合同中约定“逾期支付租金按日万分之五支付违约金”，若该比例与出租人资金成本相符，法院可能支持。

三、法院不支持或调整违约金的情形

1. 违约金过高或过低

   • 过高：若违约金远超实际损失（如损失1万元却约定违约金100万元），违约方可请求调减。法院通常以实际损失为基础，综合考虑合同履行情况、过错程度等因素调整。
     
   • 过低：若违约金显著低于实际损失（如损失100万元仅约定违约金1万元），守约方可请求增加。
     法律依据：《民法典》第五百八十五条第二款。
     举例：
     民间借贷中约定“逾期还款按日万分之五支付违约金”，但实际损失为银行同期贷款利率的四倍，若万分之五未超过法定上限（如LPR的四倍），法院可能支持；若超过，则需调整。

2. 存在显失公平或欺诈胁迫
   若违约金条款是在对方处于危困状态、缺乏判断能力时签订，或存在欺诈、胁迫情形，受损害方可主张撤销或变更。
   举例：
   开发商利用购房者急于购房的心理，强制要求签署“逾期付款按日1%支付违约金”的条款，购房者可主张撤销。

3. 格式条款未提示说明
   若违约金条款属于格式条款（如银行信用卡领用合约中的罚息条款），提供方未尽到合理提示义务，法院可能认定条款无效。
   举例：
   保险公司在保单中以极小字体标注“逾期缴费按日万分之五支付违约金”，消费者可主张不生效。

4. 违反法律强制性规定
   若违约金约定本身违法（如以违约金名义规避高利贷限制），法院将直接否定其效力。
   举例：
   民间借贷中约定“本金翻倍”作为违约金，超出法定利率上限的部分无效。

四、实务建议

1. 合同签订阶段

   • 明确约定逾期利息及违约金的计算方式（如日万分之五）和触发条件（如逾期天数）。
     
   • 确保违约金数额合理，可参考行业标准或历史案例（如银行贷款逾期利率）。
     
   • 避免使用模糊表述（如“按合理比例支付”）。

2. 争议解决阶段

   • 收集并保存实际损失的证据（如财务报表、第三方评估报告）。
     
   • 在诉讼中主动提出违约金调整的法律依据和计算依据（如实际损失、行业惯例）。
     
   • 若对方主张违约金过高或过低，需提供反证（如对方未遭受实际损失）。

总结：合同中约定逾期利息及违约金为万分之五，法院是否支持需结合约定合法性、实际损失、违约金性质及是否存在法定调整情形综合判断。建议合同双方在签订时明确约定并保留证据，争议时积极主张权利。如有具体案件，可进一步向我咨询。