结论前置：民办高中举办者股东出资不足是否合法，需结合具体情况判断，主要取决于是否符合法律法规要求、是否履行法定程序以及是否对学校运营产生实质影响。以下分情况详细说明：

1. 若出资不足违反法律法规或章程约定，则不合法

• 法律依据：根据《民办教育促进法》及其实施条例，民办学校的举办者应当按照章程规定的数额和方式足额出资，确保学校具备基本的办学条件。若股东未履行出资义务或出资不足，可能面临行政处罚（如责令限期改正、罚款等），甚至影响学校的办学资质。
• 典型情形：
  • 举办者未在章程规定的期限内完成出资；
  • 出资方式不符合规定（如以非货币财产出资但未依法评估或过户）；
  • 出资后抽逃资金。
• 后果：教育行政部门可要求补足出资，情节严重的可能吊销办学许可证。

2. 若出资不足未违反强制性规定且已履行法定程序，可能合法

• 例外情形：
  • 章程允许分期出资：若学校章程明确规定出资可分期缴纳，且举办者已按约定履行部分出资义务，剩余出资在合理期限内完成，则不构成违法。
  • 非关键性出资不足：若出资不足部分未影响学校正常运营（如未导致师资、场地等核心条件不达标），且已通过其他方式弥补（如增加政府扶持、社会捐赠），可能被认定为合法。
• 注意点：需确保程序合法，如通过董事会决议、修改章程并报教育行政部门备案。

3. 出资不足对学校运营的影响

• 实质影响：即使程序合法，若出资不足导致学校无法满足《民办教育促进法》规定的办学条件（如生均占地面积、师资比例等），仍可能被认定为违法。
• 风险防范：建议举办者定期审计财务状况，确保资金充足，避免因出资问题引发法律纠纷。

4. 实务建议

• 核查章程与出资协议：确认出资方式、期限及违约责任是否明确。
• 保留出资凭证：如银行转账记录、资产评估报告等，证明已履行出资义务。
• 及时补足或调整：若发现出资不足，应尽快通过增资、引入新股东等方式解决。

总结：民办高中举办者股东出资不足是否合法，需结合出资程序、实际影响及法律规定综合判断。若您遇到具体纠纷，可直接向我咨询，我将结合细节提供针对性建议。