公司有两个股东时，受益人并不一定只有一个。这一结论背后涉及多个方面的因素，以下是对此问题的详细分析：

一、股权结构与持股比例

1. 共同受益：

   • 在许多情况下，两个股东可能按照各自的持股比例共同享有公司的收益。例如，股东A持有60%的股份，股东B持有40%的股份，那么公司的利润将按照这一比例进行分配，两个股东都是受益人。

2. 单一最大受益人：

   • 尽管有两个股东，但如果其中一个股东持有绝大多数股份（如90%），而另一个股东持股比例很小（如10%），那么从经济利益的角度来看，持股比例大的股东可能是主要的受益人。但这并不意味着另一个股东不是受益人，只是其受益程度相对较低。

二、实际控制情况

1. 实际控制人作为受益人：

   • 实际控制人可能通过直接或间接持股、管理层控制等方式，对公司的重大决策具有决定性的话语权。在这种情况下，即使公司有两个股东，实际控制人也可能被视为主要的受益人。然而，这并不排除另一个股东作为受益人的可能性，特别是当该股东也享有公司利润分配权时。

2. 共同控制：

   • 两个股东也可能通过签署一致行动协议等方式，共同控制公司并享有公司收益。在这种情况下，两个股东都是受益人。

三、股东之间的约定

1. 股东协议：

   • 股东之间可能签署股东协议，明确约定公司的收益分配方式、受益人的身份等。根据这些约定，即使公司有两个股东，也可能确定其中一个或两个股东为受益人，或者设定其他复杂的收益分配机制。

2. 公司章程：

   • 公司章程是公司的基本法律文件，其中也可能包含关于受益人的规定。股东应仔细审查公司章程，以了解自己在公司中的权益和受益情况。

四、特殊情况

1. 股权代持：

   • 在某些情况下，实际控制人可能出于隐私保护、政策规避等考虑，安排他人代持股权。在这种情况下，虽然名义上有两个股东，但实际受益人可能只有一个（即实际控制人）。然而，这种情况涉及复杂的法律关系和潜在的法律风险，需要谨慎处理。

2. 信托或基金结构：

   • 如果公司采用信托或基金等结构进行运营，那么受益人的确定可能更加复杂。在这种情况下，需要仔细审查信托合同或基金协议等文件，以确定最终的受益人。

法律建议

• 审查公司文件：股东应仔细审查公司章程、股东协议等文件，以了解自己在公司中的权益和受益情况。
• 咨询专业律师：如果对公司受益人的确定存在疑问或争议，建议咨询专业律师以获取准确的法律意见和解决方案。

综上所述，公司有两个股东时，受益人并不一定只有一个。这取决于股权结构、实际控制情况、股东之间的约定以及可能存在的特殊情况。因此，在确定公司受益人时，需要综合考虑多个方面的因素。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。