在招投标活动中，招标人和中标人存在关联关系是否合法，需根据具体情况判断，但通常若关联关系可能影响招标公正性，则该关联关系是不被允许的，且相关投标可能被视为无效。以下是对此问题的详细分析：
一、法律规定及监管态度
相关法规：
- 根据《中华人民共和国招标投标法实施条例》第三十四条，与招标人存在利害关系可能影响招标公正性的法人、其他组织或者个人，不得参加投标。这包括单位负责人为同一人或存在控股、管理关系的不同单位。若违反此规定，相关投标均无效。
监管原则：
- 监管部门严格审查投标人与招标人的关系，旨在维护招投标的公平、公正、公开原则，防止利益输送和不正当竞争，保障市场健康运行。因此，关联关系的存在，若可能影响公正性，将受到严格监管和处罚。
二、关联关系的定义与风险
关联关系定义：
- 关联关系通常指两家公司之间存在控制、共同控制或重大影响的关系，或它们之间有亲属、持股、管理等紧密联系。这种关系可能影响招投标的公正性。
可能存在的风险：
- 利益输送风险：招标规则、评标标准等可能向关联方倾斜，损害其他投标人利益。
- 缺乏有效竞争：真正有实力的投标人可能被排除在外，影响项目质量、进度和成本。
- 损害公共利益：在涉及公共资源、公共服务的项目中，可能导致公共资金浪费和服务质量下降。
三、关联关系的识别与判断
企业登记信息查询：
- 通过工商登记档案、企业信用信息公示系统等渠道，了解双方注册信息、股东构成、法定代表人、高管人员等，判断是否存在关联。
交易历史和业务往来分析：
- 审查双方过去的交易记录、合作项目等，看是否存在频繁的业务往来或经济利益关系。
实际控制人认定：
- 深入调查双方的实际控制人是否相同或存在密切联系，包括复杂的股权结构、委托代理等方式。
四、合法性判断与应对措施
合法性判断：
- 若招标人和中标人之间的关联关系不会影响招标的公正性，且符合相关法律法规的规定，则该关联关系可能是合法的。但实践中，这种合法情况较为少见，因为关联关系往往伴随着利益输送和不正当竞争的风险。
应对措施：
- 加强信息披露：在招投标文件中明确要求披露关联关系，确保所有参与方清楚了解相关情况，增强透明度和公正性。
- 回避制度：一旦发现关联关系，相关投标人应主动回避，招标人也应严格审查投标人资格，及时排除关联方。
- 设立独立的评审机构：由无关联关系的专家组成独立评审机构，负责评审投标文件，确保评审的客观性和公正性。
- 强化监管和处罚力度：相关部门应加强监管，对违规行为依法给予严厉处罚，包括责令改正、罚款、取消投标资格、吊销营业执照等，构成犯罪的依法追究刑事责任。
五、实际案例与启示
- 在实际招投标活动中，已有多起因招标人和中标人存在关联关系而被处罚的案例。这些案例表明，关联关系的存在往往伴随着不正当竞争和利益输送的风险，严重损害了招投标的公平性和公正性。因此，招标人和投标人应严格遵守相关法律法规，避免存在关联关系或采取有效措施消除关联关系对招标公正性的影响。
综上所述，招标人和中标人之间的关联关系是否合法需根据具体情况判断，但通常若关联关系可能影响招标公正性，则是不被允许的。如有具体法律问题或疑虑，建议直接向我咨询以获取更详细的指导和帮助。