结论前置：事业单位在编人员签了5年服务期但中途辞职，是否需要支付全部违约金，主要取决于劳动合同或聘用合同中的具体约定以及这些约定的合法性。若合同中有合法且合理的违约金条款，并且劳动者违反了相关约定，那么可能需要支付违约金，但违约金数额有法定限制；若无此类特殊约定或约定不合法，则一般不需要支付全部违约金。
详细分析：
需要支付违约金的情形：
- 违反服务期约定：根据《中华人民共和国劳动合同法》第二十二条，如果事业单位为劳动者提供了专项培训费用，并进行了专业技术培训，同时双方签订了服务期协议，那么劳动者在服务期内辞职，将需要按照协议约定支付违约金。但违约金的数额不得超过用人单位提供的培训费用，并且不得超过服务期尚未履行部分所应分摊的培训费用。例如，若单位提供了10万元的培训费用，约定服务期为5年，劳动者在服务3年后辞职，则需支付剩余2年服务期对应的4万元违约金（10万元 / 5年 * 2年）。
- 违反竞业限制约定：如果劳动者与事业单位签订了竞业限制协议，并在服务期内辞职后违反了该协议的相关规定，那么劳动者也需要按照协议约定向用人单位支付违约金。
不需要支付全部违约金的情形：
- 无特殊约定：若劳动者与事业单位之间没有签订任何关于服务期、竞业限制或培训费用的特殊约定，那么劳动者在服务期内辞职一般不需要支付违约金。
- 单位违法违规行为：根据《中华人民共和国劳动合同法》第三十八条，若事业单位存在未及时足额支付劳动报酬、未依法缴纳社会保险费等违法违规行为，劳动者可以合法解除劳动合同，且无需支付违约金。
- 正常辞职程序：即使存在服务期协议，但如果劳动者按照法定或约定的程序提前通知了事业单位，并按照规定办理了辞职手续，且不存在其他需支付违约金的情形（如违反培训费用分摊约定），则通常无需支付违约金。
- 违约金条款不合法或不合理：若合同中的违约金条款存在不合理之处（如数额过高、期限过长等），或者与法律法规相抵触，劳动者有权请求相关部门或法院进行调整或认定该条款无效。
法律建议：
- 在决定辞职前，劳动者应仔细阅读劳动合同或聘用合同中关于违约金的条款，并评估其合法性与合理性。
- 若对合同条款存在疑问或争议，建议及时向我咨询以获取准确的法律意见。
- 在辞职过程中，应保留好所有相关证据（如劳动合同、培训记录、工资单等），以备不时之需。
可能法律后果：
- 如果劳动者违反服务期或竞业限制约定辞职，并对用人单位造成了经济损失，除了可能需要支付违约金外，劳动者还需要依法承担赔偿责任。
- 如果单位设定的违约金条款不合法或不合理，劳动者有权拒绝支付，并可能通过法律途径维护自己的合法权益。
综上所述，事业单位在编人员签了5年服务期但中途辞职，是否需要支付全部违约金是一个复杂的问题，需要根据具体情况来判断。劳动者在做出决定前应充分了解自己的权益和义务，并寻求专业的法律支持以确保自身合法权益得到保障。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。