银行贷款逾期者的农业补贴被银行扣还贷款利息，这一行为是否合理，需分情况讨论：
若贷款合同中有明确约定：
- 合理情况：如果贷款合同中明确规定了银行在贷款逾期时有权从借款人的其他收入（包括农业补贴）中直接扣款以偿还贷款利息或本金，那么银行的行为是合理的。这是因为合同是双方自愿达成的协议，具有法律约束力，双方都应遵守合同条款。
- 法律依据：根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，当事人可以约定一方根据合同约定向对方给付定金作为债权的担保。债务人履行债务的，定金应当抵作价款或者收回。虽然这里提及的是定金，但合同约定的权利义务关系同样适用于贷款合同中的其他条款，包括银行在特定情况下的扣款权。
若贷款合同中无明确约定：
- 不合理情况：如果贷款合同中没有明确规定银行可以从借款人的农业补贴中扣款以偿还贷款利息，那么银行的行为可能构成侵权。因为农业补贴是政府给予农民的特定补助，旨在支持农业生产，银行无权擅自扣留。
- 法律后果：在此情况下，借款人可以通过法律途径维护自己的权益，如向法院提起诉讼，要求银行返还被扣留的农业补贴，并可能要求银行承担因侵权行为造成的损失。
特殊情况考虑：
- 银行行使抵销权：在某些情况下，银行可能依据法律规定行使抵销权。但抵销权的行使通常需要满足一定的条件，如双方互负债务、债务均已到期等。如果银行未经借款人同意，擅自从其农业补贴中扣款，且不符合抵销权的行使条件，那么银行的行为仍然是不合法的。
- 政府补贴的专款专用性质：农业补贴通常具有专款专用的性质，即这些资金只能用于特定的农业生产活动。银行擅自扣留这些资金，可能违反了政府补贴的初衷和规定。
建议与行动：
- 核查合同条款：首先，借款人应仔细核查贷款合同的条款，特别是关于银行扣款权的规定。
- 与银行沟通：如果发现银行的行为与合同条款不符，借款人应与银行进行沟通，要求银行说明扣款的理由和依据。
- 寻求法律帮助：如果沟通无果，借款人可以寻求法律帮助，通过法律途径维护自己的权益。
总结：银行贷款逾期者的农业补贴被银行扣还贷款利息是否合理，主要取决于贷款合同中是否有明确约定。如果有约定，则银行的行为可能是合理的；如果没有约定，则银行的行为可能构成侵权。在任何情况下，借款人都应了解自己的权益，并在必要时寻求法律帮助。如果您有进一步的法律问题或需要更具体的建议，请直接向我咨询。