结论：法人的房产用于自己公司经营并支付租金，在法律上并非绝对不合理，但需根据具体情况判断其合理性与合法性。

1. 法律关系分析

• 法人财产与公司财产的独立性：根据《公司法》及相关规定，法人（如自然人股东或法人股东）的财产与公司财产原则上应相互独立。若法人将个人房产用于公司经营，并收取租金，需明确该行为是否构成财产混同。若房产登记在法人个人名下，但实际用于公司经营，且租金支付有合理依据（如市场价租金、租赁合同等），则法律上可能被视为合法行为。
• 租赁合同的效力：若法人与公司签订了正式的租赁合同，明确了租金标准、支付方式等条款，且租金符合市场水平，则该行为具有法律效力。但若租金明显低于市场价或无合理依据，可能被视为利益输送或逃避税收，存在法律风险。

2. 税务合规性

• 租金收入的税务处理：法人作为房产所有者，收取的租金应依法缴纳个人所得税或企业所得税（取决于法人类型）。若未申报或偷逃税款，可能面临税务处罚。
• 公司支出的税务抵扣：公司支付的租金若符合税法规定（如用于生产经营、有合法凭证等），可作为成本或费用在税前扣除。但若租金支付无合理依据或凭证不全，可能无法抵扣，甚至引发税务稽查。

3. 潜在法律风险

• 财产混同风险：若法人财产与公司财产混同，可能导致公司人格否认（即“刺破公司面纱”），法人需对公司债务承担连带责任。
• 利益输送嫌疑：若租金明显偏离市场价，可能被视为股东与公司之间的不正当利益输送，损害其他股东或债权人利益。
• 合同无效风险：若租赁合同存在欺诈、胁迫等情形，或违反法律、行政法规的强制性规定，可能被认定为无效合同。

4. 建议与操作要点

• 签订正式租赁合同：明确租金标准、支付方式、租赁期限等条款，确保合同合法有效。
• 租金定价合理：参考市场价确定租金，避免过高或过低。
• 依法纳税：法人应依法申报租金收入并缴纳税款；公司应确保租金支出有合法凭证并符合税法规定。
• 避免财产混同：保持法人财产与公司财产的独立性，避免资金、资产等混同使用。

总结：法人的房产用于自己公司经营并支付租金，在法律上并非绝对不合理，但需确保租赁合同合法有效、租金定价合理、依法纳税并避免财产混同。若存在疑问或风险，建议直接向我咨询，以便进一步分析并制定合规方案。