结论：工厂因租户拖欠水费而直接关闭大门不让其进入，这一做法通常是不合法的，工厂应当通过合法途径来追讨欠费，而不是采取私自限制租户进入的方式。
法律背景与解释：
租赁合同关系：工厂与租户之间存在租赁合同关系，双方应当按照合同约定履行各自的义务。租户拖欠水费，属于违反合同约定的行为，工厂有权要求租户支付欠费。但是，工厂并不因此获得直接限制租户进入工厂的权利。
物权保护：租户在租赁期间享有对租赁物的使用、收益权。工厂关闭大门，实际上是对租户物权的一种侵犯，除非合同中有明确约定或法律另有规定，否则工厂无权这样做。
合法追讨方式：如果租户拖欠水费，工厂应当通过合法途径来追讨，如与租户协商、发送催款通知、提起诉讼等。工厂可以依据租赁合同中的相关条款，要求租户支付欠费及可能产生的违约金。如果租户拒不支付，工厂可以向法院提起诉讼，通过法律手段来维护自己的权益。
法律建议：
与租户协商：工厂可以先尝试与租户进行协商，了解拖欠水费的原因，并寻求双方都能接受的解决方案。
发送催款通知：如果协商无果，工厂可以向租户发送正式的催款通知，明确要求租户在规定时间内支付欠费，并告知其可能面临的法律后果。
提起诉讼：如果租户仍然拒不支付欠费，工厂可以向法院提起诉讼，要求租户支付欠费及可能产生的违约金。在诉讼过程中，工厂需要提供充分的证据来证明租户拖欠水费的事实以及自己的损失。
可能的法律后果：
工厂被要求赔偿：如果工厂因关闭大门而给租户造成损失，如租户因此无法正常经营或产生其他经济损失，工厂可能需要承担相应的赔偿责任。
工厂面临行政处罚：如果工厂的行为违反了相关法律法规或行政规定，如未经许可擅自关闭大门等，工厂还可能面临行政处罚。
因此，工厂在处理租户拖欠水费的问题时，应当保持冷静和理性，通过合法途径来维护自己的权益，而不是采取私自限制租户进入等可能引发法律纠纷的方式。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。