若认为行政机关的文件不合法，可以向有管辖权的复议机关申请行政复议，或者向有管辖权的人民法院提起行政诉讼，要求审查该文件的合法性。以下是对这两种途径的详细解释：
一、行政复议途径
复议机关的选择：
- 根据《中华人民共和国行政复议法》的相关规定，对县级以上地方各级人民政府工作部门的具体行政行为不服的，由申请人选择，可以向该部门的本级人民政府申请行政复议，也可以向上一级主管部门申请行政复议。
- 对海关、金融、国税、外汇管理等实行垂直领导的行政机关和国家安全机关的具体行政行为不服的，向上一级主管部门申请行政复议。
复议申请的内容：
- 申请人需要提交行政复议申请书，并附上相关证据材料，如行政机关的文件、决定书等。
- 申请书应明确指出行政机关的文件不合法，并说明理由和依据。
复议结果：
- 复议机关将对申请进行审查，并作出复议决定。如果认为行政机关的文件确实不合法，复议机关可以撤销、变更或者确认该文件违法。
二、行政诉讼途径
诉讼法院的选择：
- 根据《中华人民共和国行政诉讼法》的相关规定，对行政机关的具体行政行为不服的，可以向有管辖权的人民法院提起行政诉讼。
- 一般来说，行政诉讼由最初作出具体行政行为的行政机关所在地的人民法院管辖。
诉讼材料准备：
- 原告需要准备起诉状，并附上相关证据材料，如行政机关的文件、决定书、复议决定书（如果已申请复议）等。
- 起诉状应明确指出行政机关的文件不合法，并说明理由和依据，同时提出具体的诉讼请求。
诉讼过程与结果：
- 法院将对案件进行审理，并作出判决。如果认为行政机关的文件确实不合法，法院可以判决撤销、变更或者确认该文件违法，并可以责令行政机关重新作出具体行政行为。
三、其他注意事项
时效性：
- 无论是申请行政复议还是提起行政诉讼，都需要注意时效性。一般来说，行政复议的申请期限为知道该具体行政行为之日起六十日内，而行政诉讼的起诉期限为知道或者应当知道作出行政行为之日起六个月内（法律另有规定的除外）。
证据收集：
- 在申请行政复议或提起行政诉讼前，应尽可能收集相关证据材料，以支持自己的主张。证据可以包括书面材料、证人证言、视听资料等。
法律援助：
- 如果觉得自己无法独立处理这些法律事务，可以考虑寻求法律援助或咨询专业律师（如我本人，毛杰律师，专注于经济纠纷、公司事务、行政纠纷等领域）。
综上所述，若认为行政机关的文件不合法，可以通过行政复议或行政诉讼途径来寻求法律救济。在选择途径时，应根据具体情况和自身需求进行考虑，并注意时效性和证据收集等问题。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。