若男方不承认某些事实或不同意离婚，而女方仍希望起诉离婚，其程序和手续主要如下：
一、起诉前的准备
收集证据：
- 女方需要收集能够证明夫妻感情确已破裂的证据，如分居证明、通讯记录、证人证言等。
- 若男方存在过错（如出轨、家暴等），女方还需收集相关证据以支持自己的诉求。
撰写起诉状：
- 起诉状应明确原告（女方）和被告（男方）的基本信息、诉讼请求（如请求判决离婚、子女抚养权归属、财产分割等）、事实与理由（阐述夫妻感情破裂的原因及男方的不当行为）等。
二、向法院提起诉讼
选择管辖法院：
- 女方应向被告（男方）户籍所在地或经常居住地的人民法院提起诉讼。
提交起诉材料：
- 女方需将起诉状及相关证据材料提交给法院，并缴纳诉讼费。
三、法院审理流程
立案审查：
- 法院会对女方的起诉材料进行审查，确认是否符合立案条件。
开庭审理：
- 若法院决定立案，会安排开庭时间，并通知双方当事人到庭参加审理。
- 在庭审过程中，女方需陈述自己的诉讼请求及事实与理由，并提供证据支持。
- 男方有权进行答辩，并提供反驳证据。
调解与判决：
- 法院在审理过程中会尝试进行调解，若调解成功，双方可达成离婚协议。
- 若调解不成，法院会根据双方提供的证据及法律规定作出判决。
- 若法院认为夫妻感情确已破裂，且无和好可能，会判决离婚。
四、后续手续
领取判决书：
- 女方在收到法院的判决书后，需确认判决内容是否符合自己的诉求。
办理离婚手续：
- 若判决书生效，双方需按照判决书的内容办理离婚手续，如财产分割、子女抚养权交接等。
- 若涉及财产分割或子女抚养权争议，双方可协商解决或向法院申请强制执行。
五、特别提示
- 男方不承认或不同意的影响：男方的态度不会影响法院对案件的审理和判决。法院会根据双方提供的证据及法律规定作出公正判决。
- 证据的重要性：在起诉离婚过程中，证据是支持女方诉求的关键。因此，女方应尽可能收集全面、真实的证据。
- 法律程序的复杂性：起诉离婚涉及多个法律程序，女方可能需花费一定时间和精力。建议女方在起诉前咨询专业律师，以更好地了解法律程序和自身权益。
若女方在起诉离婚过程中遇到任何问题或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。我会根据女方的具体情况提供专业的法律建议和支持。