结论：车主先行赔付后，保险公司是否赔偿需分情况讨论，具体取决于保险合同条款、事故责任认定及赔付范围。以下是详细分析：

1. 若车主赔付金额未超过保险责任限额，且符合保险合同约定

• 保险公司仍需赔偿：根据《机动车交通事故责任强制保险条例》及商业第三者责任险条款，保险公司应在责任限额内对第三方损失进行赔偿。若车主先行垫付的金额未超过保险责任范围（如交强险医疗费限额1.8万元、死亡伤残限额18万元，或商业险限额），且赔付项目属于保险责任（如医疗费、误工费、护理费等），保险公司需对车主已垫付的部分进行报销。
• 操作流程：车主需保留赔付凭证（如收据、转账记录、赔偿协议等），并向保险公司提交理赔申请，保险公司审核后将赔款支付至车主账户。

2. 若车主赔付金额超过保险责任限额，或赔付项目不属于保险责任

• 超出部分保险公司不赔：例如，车主自愿赔偿精神损害抚慰金、非医保用药费用（若商业险条款约定免赔），或赔付总额超过交强险及商业险的累计限额，超出部分需由车主自行承担，保险公司不予赔偿。
• 免责条款生效：若事故涉及酒驾、无证驾驶等保险免责情形，或车主未及时报案导致保险公司无法定损，保险公司可能拒绝赔偿。

3. 若车主与受害人达成“私了”协议，未通知保险公司

• 保险公司可能拒赔：根据《保险法》第二十一条，投保人、被保险人或受益人知道保险事故发生后，应及时通知保险人。若车主未经保险公司定损直接赔付，可能导致保险公司对损失金额存疑，甚至以“未履行通知义务”为由拒赔。
• 例外情形：若车主能证明赔付金额合理（如提供医院发票、维修清单等），且保险公司无证据反驳，法院可能支持车主的报销请求。

建议

1. 事故后立即报案：车主应第一时间联系保险公司并报警，由保险公司定损后再协商赔偿，避免私了导致理赔纠纷。
2. 保留证据：赔付时要求受害人出具书面收据及赔偿明细，并留存医疗记录、维修发票等原始凭证。
3. 审核保险合同：确认商业险是否包含“不计免赔险”“法律费用险”等附加险种，以扩大保障范围。

如有进一步疑问，可直接向我咨询具体案件处理方案。