结论前置：两人共抵一套房子，落户仅登记一人名字时，需通过书面协议明确产权归属、出资比例、权利义务及违约责任，以避免后续纠纷。以下为协议撰写要点及示例条款：

一、协议核心条款

1. 产权归属约定

   • 明确房屋登记人仅为代持方，实际产权按出资比例共有（如按份共有或共同共有）。
     
   • 示例条款：
     > “甲方为房屋登记权利人，但房屋实际由甲、乙双方按XX%:XX%比例共有，乙方享有相应产权份额。”

2. 出资比例与资金管理

   • 详细列明双方出资方式（如首付、贷款还款、税费等）及比例。
     
   • 示例条款：
     > “房屋总价款为人民币XX万元，其中甲方出资XX万元（占XX%），乙方出资XX万元（占XX%）。贷款部分由双方按比例共同偿还。”

3. 权利义务分配

   • 明确房屋使用、收益（如出租收入）、管理（如维修、装修）的分配规则。
     
   • 示例条款：
     > “房屋出租所得收益按出资比例分配，日常维护费用由双方按比例承担。”

4. 违约责任与争议解决

   • 约定一方违约时的赔偿方式（如违约金、损失计算）及争议解决途径（如诉讼或仲裁）。
     
   • 示例条款：
     > “若一方未经另一方同意擅自处分房屋，需向对方支付房屋总价款20%的违约金，并赔偿实际损失。”

二、协议形式与效力

1. 书面形式

   • 协议必须采用书面形式，双方签字并按手印，必要时可公证以增强证据效力。

2. 登记备案

   • 若涉及贷款，需与银行沟通确认代持协议是否影响贷款合同效力，避免因隐瞒真实产权关系导致违约。

三、风险提示与建议

1. 法律风险

   • 若未明确约定，登记人可能被认定为唯一产权人，共有人权益难以保障。
     
   • 示例风险：登记人私自出售房屋，共有人可能无法追回款项。

2. 操作建议

   • 优先办理共有权证：若条件允许，可申请将双方名字均登记在产权证上（如按份共有）。
     
   • 定期对账：保留出资凭证（如转账记录、收据），避免因时间久远导致证据灭失。
     
   • 婚前财产约定：若双方为情侣或夫妻，需额外签署《婚前财产协议》，明确房屋性质。

四、协议示例（简化版）

房屋共有协议  
甲方（登记人）：________  
乙方（共有人）：________  

1. 房屋地址：________，产权证号：________。  
2. 产权归属：甲方占__%，乙方占__%，乙方份额由甲方代持。  
3. 出资方式：甲方出资__万元，乙方出资__万元，贷款部分按比例偿还。  
4. 违约责任：任何一方违约，需支付房屋总价款__%的违约金。  
5. 争议解决：协商不成，提交________（法院/仲裁委）管辖。  

甲方（签字）：________  
乙方（签字）：________  
日期：________  

如有进一步疑问（如协议公证、贷款协调等），可直接向我咨询，我将结合具体案情提供详细方案。