结论：租赁合同中约定免费使用期限，超过该期限后是否需要支付租金，主要取决于租赁合同中的具体条款以及双方的实际约定。若合同中有明确约定超过免费期限后的租金支付方式，则应按照合同约定执行；若合同未明确约定，则可能需要根据实际情况和法律规定进行协商或诉讼解决。
详细分析：
合同有明确约定：
- 如果租赁合同中明确规定了免费使用的期限，并且也明确指出了超过该期限后租金的支付方式（如按日、按月支付，以及具体的租金金额或计算方式），那么双方应当严格按照合同约定执行。
- 例如，合同可能规定：“乙方可免费使用该房屋前三个月，自第四个月起，乙方需按月支付租金人民币5000元。”在这种情况下，超过免费期限后，乙方就需要按照每月5000元的标准支付租金。
合同未明确约定：
- 如果租赁合同中只规定了免费使用的期限，但没有明确指出超过该期限后租金的支付方式，那么双方可能需要通过协商来解决租金支付问题。
- 在协商过程中，双方可以参考市场租金水平、房屋的实际状况、租赁期限的长短等因素来确定一个合理的租金金额。
- 如果协商不成，双方可能会选择通过诉讼或仲裁等法律途径来解决争议。在这种情况下，法院或仲裁机构会根据相关法律法规、市场情况以及双方的实际情况来作出裁决。
法律建议：
- 在签订租赁合同时，双方应当尽可能明确、详细地约定租赁期限、租金支付方式、免费使用期限等关键条款，以避免后续产生争议。
- 如果合同中存在模糊或不明确的地方，双方应当及时沟通并达成补充协议，以确保合同的顺利执行。
- 在发生争议时，双方应当保持冷静和理性，通过协商、调解等和平方式解决争议；如果无法达成一致意见，再考虑通过法律途径解决。
可能后果：
- 如果承租方在超过免费使用期限后拒绝支付租金，出租方有权要求承租方按照合同约定或市场租金水平支付租金，并可能要求承租方承担违约责任（如支付违约金、赔偿损失等）。
- 如果双方无法就租金支付问题达成一致意见，并且无法通过协商、调解等方式解决争议，那么出租方或承租方可能会选择向法院提起诉讼或向仲裁机构申请仲裁，这将耗费双方的时间和精力，并可能产生额外的法律费用。
因此，在处理租赁合同中的免费使用期限和租金支付问题时，双方应当谨慎对待合同条款的约定，并在发生争议时积极寻求和平解决方案。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。