协议中规定“以后再商议”的条款，在符合法律规定且不违背公序良俗的情况下，是具有法律效应的，但其效力及具体影响需结合实际情况分析。以下从不同角度进行详细说明：

一、条款的法律效力基础

1. 意思表示真实：根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，民事法律行为有效的条件之一是行为人具有相应的民事行为能力，且意思表示真实。若协议双方在签订时均明确表示“以后再商议”的具体事项，并同意将此作为协议的一部分，则该条款体现了双方的真实意思，具有法律效力。

2. 不违反法律、行政法规的强制性规定：协议内容不得违反法律、行政法规的强制性规定，否则该条款或整个协议可能被认定为无效。若“以后再商议”的条款不涉及违法内容，则其法律效力不受影响。

3. 不违背公序良俗：公序良俗是民事法律行为有效的重要原则。若“以后再商议”的条款不违背公序良俗，如不涉及欺诈、胁迫、恶意串通等情形，则其具有法律效力。

二、条款的具体影响及后续操作

1. 条款的不确定性：

   • “以后再商议”的条款具有不确定性，其具体内容、履行方式、时间等均需在后续协商中确定。这可能导致协议在履行过程中出现争议或纠纷。
   • 为减少不确定性，双方可在协议中约定协商的时间、地点、方式等，或设定协商不成的解决机制，如仲裁、诉讼等。

2. 后续协商的义务：

   • 双方均有义务就“以后再商议”的事项进行诚实信用的协商。若一方拒绝协商或协商不成，可能构成违约，需承担相应的违约责任。
   • 在协商过程中，双方应充分交换意见，寻求共识，以达成对双方均有利的协议。

3. 条款的补充与完善：

   • 若双方就“以后再商议”的事项达成一致，应及时签订补充协议，明确双方的权利义务，以避免后续争议。
   • 补充协议应与原协议具有同等法律效力，双方均应严格遵守。

三、特殊情况下的条款效力

1. 格式条款中的“以后再商议”：

   • 若协议为格式条款，且“以后再商议”的条款未以合理方式提示对方注意，或对方未对该条款表示同意，则该条款可能被认定为无效。
   • 格式条款提供方应确保条款内容公平、合理，并充分提示对方注意重要条款。

2. 附条件或附期限的条款：

   • 若“以后再商议”的条款附有条件或期限，则该条款的效力取决于条件是否成就或期限是否届满。
   • 双方应明确约定条件或期限的具体内容，以避免后续争议。

四、法律建议

1. 明确条款内容：在签订协议时，双方应尽可能明确“以后再商议”的具体事项、协商方式、时间等，以减少不确定性。

2. 设定解决机制：为应对协商不成的情况，双方可设定仲裁、诉讼等解决机制，以确保协议的有效履行。

3. 及时补充协议：若双方就“以后再商议”的事项达成一致，应及时签订补充协议，明确双方的权利义务。

4. 寻求法律帮助：在签订协议或协商过程中，若遇到法律问题或争议，可及时寻求专业律师的帮助，以确保自身权益得到保障。

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