双方商定的协议在满足一定条件下是具有法律效力的。以下是对此问题的详细分析，旨在帮助您全面理解协议法律效力的相关要点：

一、协议有效的基本条件

1. 行为人具有相应的民事行为能力：

   • 协议双方必须具备能够理解自己行为性质和后果，并独立实施该行为的能力。例如，完全民事行为能力人（如年满18周岁的精神正常成年人）可以独立签订协议；而限制民事行为能力人（如未成年人或精神病人）签订的与其年龄、智力不相适应的协议，则需法定代理人追认后才有效。

2. 意思表示真实：

   • 协议内容必须是双方真实意愿的体现，不存在欺诈、胁迫、重大误解等情形。若一方通过不正当手段使另一方在错误认识下签订协议，受损害方有权请求法院或仲裁机构撤销该协议。

3. 内容合法且不违背公序良俗：

   • 协议内容必须符合法律规定，不得违反法律、行政法规的强制性规定，也不得违背社会公共秩序和善良风俗。例如，买卖毒品、枪支等违禁品的协议是无效的，因为这类协议明显违反了法律规定。

4. 形式符合要求：

   • 对于某些特定类型的协议，如不动产买卖合同，法律可能要求采用书面形式并进行登记备案。若未按照规定的形式签订，可能影响协议的效力。

二、协议无效的情形

1. 欺诈、胁迫损害国家利益：

   • 一方以欺诈、胁迫手段订立协议，且损害国家利益的，该协议无效。

2. 恶意串通：

   • 双方恶意串通，损害国家、集体或者第三人利益的，该协议无效。

3. 合法形式掩盖非法目的：

   • 以合法形式掩盖非法目的的协议，如买卖毒品等违法活动，该协议无效。

4. 损害社会公共利益：

   • 任何损害社会公共利益的协议均属无效。

5. 违反法律、行政法规的强制性规定：

   • 此类协议同样无效。

三、特殊类型协议的生效条件

1. 书面形式与登记要求：

   • 某些特殊类型的协议，如房屋买卖合同、不动产抵押合同等，可能需要采用书面形式并办理相关登记手续才能生效。这是为了确保交易的合法性和安全性。

2. 离婚协议：

   • 离婚协议属于附条件生效的协议，以“离婚”为生效条件。若双方已离婚，则协议内容有效；若未离婚，则协议尚未生效。在离婚诉讼中，即使双方已签字，但如一方反悔且法院认定协议未生效，仍可能根据实际情况对夫妻共同财产进行分割。

四、法律后果与建议

• 法律后果：一旦协议满足上述所有条件并生效，就对双方都产生法律约束力。双方应按照协议约定履行各自的义务，否则将承担违约责任，包括赔偿损失等。
• 建议：在签订协议时，双方应确保具备相应的民事行为能力、表达真实意愿、协议内容合法且不违背公序良俗，并注意特殊类型协议的特定要求和生效条件。如有必要，可寻求专业律师的帮助进行审查和把关，以确保协议的有效性和合法性。

综上所述，双方商定的协议在满足一定条件下是具有法律效力的。但为了确保协议的有效性和合法性，双方在签订协议时应谨慎对待每一个环节。如果您在签订协议过程中遇到任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。