关于代开苗木发票是否违法的问题，这并非一个简单的“是”或“否”的答案，而是需要根据具体情况来判断。以下是我为您提供的详细解答：

一、合法代开的情形

在特定情况下，代开苗木发票（或更广泛地说，代开任何类型的发票）是合法的。这主要指的是通过税务机关依法进行的代开。例如，符合条件的小规模纳税人等特定主体，因自身无法自行开具增值税专用发票，可以向税务机关申请代开。这种情况下，代开发票是遵循了《中华人民共和国发票管理办法》等相关法律法规的，因此是合法的。

二、非法代开的情形

与合法代开相对，非法代开苗木发票则是严重的违法行为。这主要包括以下两种情形：

1. 虚开发票：

   • 虚开发票是指没有真实交易或劳务发生，却为他人、为自己、让他人为自己、介绍他人开具发票的行为。这种行为不仅违反了税收法律法规，还可能构成犯罪。根据《中华人民共和国刑法》的规定，虚开增值税专用发票或用于骗取出口退税、抵扣税款的其他发票的，将受到严厉的刑事处罚。

2. 非法代开普通发票：

   • 除税务机关外，其他单位和个人代开发票也是违法的。这包括个人通过非法渠道或中介机构代开发票的行为。这些非法渠道往往无法提供真实的发票，甚至可能涉及其他税收违法行为。税务机关会对这种非法代开行为进行严厉打击，并对相关责任人进行处罚。

三、针对苗木发票的具体建议

对于您提到的苗木发票，如果您是苗木的销售方或购买方，且需要开具发票，建议您遵循以下原则：

• 确保业务真实性：发票的内容必须真实、准确，与实际交易相符。这是合法代开发票的基础。
• 选择正规途径：如果需要代开发票，应前往正规的税务机关或税务机关委托的单位进行办理。避免通过非法途径或中介机构代开发票。
• 遵守税收法律法规：在开具和接收发票的过程中，应严格遵守税收法律法规，不得利用发票进行偷税、逃税等违法行为。

四、总结

综上所述，代开苗木发票的合法性取决于代开的主体和程序是否符合法律规定。任何单位和个人都应严格遵守税收法律，不得擅自代开发票，以免触犯法律。对于需要开具发票的情况，应依法向税务机关申请或按照相关规定办理，确保发票的真实性和合法性。如果您在代开发票的过程中遇到任何问题或疑虑，建议咨询专业的税务顾问或律师以获取更具体的指导。