非法经营同类营业罪中，公司企业重大损失额的依据主要来源于法律对“数额巨大”的界定以及实际损失的计算。以下是对这一问题的详细分析：

一、法律对“数额巨大”的界定

根据《中华人民共和国刑法》第一百六十五条以及《最高人民检察院、公安部关于公安机关管辖的刑事案件立案追诉标准的规定（二）》的相关规定，非法经营同类营业罪中“数额巨大”的具体标准为：国有公司、企业的董事、经理利用职务便利，自己经营或者为他人经营与其所任职公司、企业同类的营业，获取非法利益，数额在十万元以上的，即应予以立案追诉。这一规定为司法机关在实际操作中提供了明确的数额标准，是判断公司企业是否遭受重大损失的重要依据之一。不过，此处的“数额巨大”主要指的是行为人获取的非法利益数额，它反映了犯罪行为的严重程度，但并不直接等同于公司企业的实际损失额。

二、公司企业实际损失额的计算

公司企业的实际损失额通常涉及多个方面，包括但不限于：

1. 商业机会与利润的流失：

   • 行为人利用职务便利，将本应属于公司的商业机会和利润转移给自己或他人经营的同类企业，导致公司直接经济损失。这种损失可以通过比较行为前后公司的预期利润与实际利润来计算。

2. 资源的滥用与浪费：

   • 行为人将公司的资金、技术、客户等核心资源用于自己的同类营业，造成公司资源的严重流失和浪费。这些资源的价值可以通过市场评估或专业机构鉴定来确定，进而计算公司因资源流失而遭受的损失。

3. 市场竞争力与声誉的损害：

   • 行为人的非法经营行为可能削弱公司的市场竞争力，损害公司的声誉和信誉，进而影响公司的长期发展和市场地位。这种损失虽然难以直接量化，但可以通过市场调研、客户反馈等方式来评估其对公司的影响程度。

三、法律建议与操作指南

1. 加强内部监管：

   • 公司应建立健全内部监管机制，加强对董事、经理等高管的监督和管理，防止其利用职务便利从事非法经营同类营业的行为。

2. 及时收集证据：

   • 一旦发现高管存在非法经营同类营业的行为，公司应及时收集相关证据，包括但不限于合同、交易记录、财务数据等，以便在后续的法律程序中维护自身权益。

3. 寻求法律帮助：

   • 在处理此类案件时，公司应寻求专业律师的帮助，确保法律程序的合法性和有效性。律师可以根据具体情况为公司提供法律建议和操作指南，帮助公司更好地维护自身权益。

举例说明：假设某国有公司的董事利用职务便利，自己经营了一家与该公司同类的企业，并获取了非法利益20万元。同时，由于该董事的行为，导致原公司失去了一个重要的商业机会，预期利润为50万元。在此情况下，公司不仅可以依据法律对“数额巨大”的界定（10万元以上）追究该董事的刑事责任，还可以通过民事诉讼要求该董事赔偿公司因商业机会流失而遭受的实际损失（50万元）。

综上所述，非法经营同类营业罪中公司企业重大损失额的依据主要来源于法律对“数额巨大”的界定以及实际损失的计算。在实际操作中，公司应结合具体情况，采取相应的法律措施来维护自身权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。