结论：合同签了三年但履行时间未满三年，是否需要全额缴纳印花税，这主要取决于合同类型以及印花税的相关规定。一般情况下，若合同属于应税凭证且已贴花，无论合同是否完全履行，均不需再补缴印花税；若合同未贴花或属于特殊类型合同，则需根据具体情况判断是否需要缴纳及缴纳金额。以下为详细分析：
一、一般合同情况
印花税缴纳原则：
- 印花税是对经济活动和经济交往中书立、领受具有法律效力的凭证（如合同、产权转移书据、营业账簿、权利许可证照等）所征收的一种税。
- 印花税的缴纳通常基于合同的签订，而非合同的履行情况。即，一旦合同签订并符合印花税的征税范围，纳税人就应在合同签订时按规定的税率计算并缴纳印花税。
合同履行与印花税的关系：
- 合同的履行情况（如履行期限、履行金额等）通常不影响印花税的缴纳。即使合同未完全履行或提前终止，已缴纳的印花税一般也不予退还或抵扣。
- 因此，在您的情况下，如果合同已经签订并符合印花税的征税范围，且已经按规定的税率缴纳了印花税，那么无论合同是否履行满三年，都不需要再补缴印花税。
二、特殊合同情况
未贴花合同：
- 如果合同在签订时未按规定贴花（即未缴纳印花税），且后续被发现或需要补缴，那么纳税人应按合同金额和规定的税率计算并补缴印花税。此时，补缴的金额与合同是否履行满三年无关，而是基于合同的实际金额。
特殊类型合同：
- 某些特殊类型的合同（如借款合同、融资租赁合同等）可能涉及印花税的特殊规定。例如，借款合同可能按借款金额的一定比例缴纳印花税，而融资租赁合同则可能按租金总额的一定比例缴纳。
- 对于这些特殊类型的合同，是否需要全额缴纳印花税以及缴纳的具体金额，应依据相关税收法规和合同的具体条款来确定。
三、实际操作建议
查阅合同条款：
- 首先，应仔细查阅合同的具体条款，确定合同类型以及是否涉及印花税的缴纳。
咨询税务机关：
- 如果对印花税的缴纳有疑问或不确定，建议咨询当地税务机关或专业税务顾问，以获取准确的税务指导和建议。
保留相关凭证：
- 在缴纳印花税时，应妥善保留相关凭证（如完税证明、印花税票等），以备后续查验和核对。
最后，印花税的缴纳通常基于合同的签订而非履行情况。在您的情况下，如果合同已经签订并符合印花税的征税范围且已贴花，则无需因合同未履行满三年而补缴印花税。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。