小区内业主占用公共绿地建小院，这一行为主要由县级以上地方人民政府城乡规划主管部门以及乡、镇人民政府负责管理。具体分析如下：

一、管理部门的法律依据

1. 县级以上地方人民政府城乡规划主管部门：

   • 根据《中华人民共和国城乡规划法》第六十四条，未取得建设工程规划许可证或未按照许可证规定进行建设的，由县级以上地方人民政府城乡规划主管部门负责处理，包括责令停止建设、限期改正、处以罚款等措施。这意味着，如果业主在公共绿地上建设小院，且未取得相应的规划许可，那么这一行为就属于该部门的管辖范围。

2. 乡、镇人民政府：

   • 同样，根据《中华人民共和国城乡规划法》第六十五条，对于在乡、村庄规划区内未依法取得乡村建设规划许可证或未按照许可证规定进行建设的，由乡、镇人民政府负责处理，包括责令停止建设、限期改正以及拆除等措施。如果小区位于乡、村庄规划区内，且业主的建设行为违反了规划，那么乡、镇人民政府也有权进行管理。

二、管理部门的职责与措施

• 认定违建：上述部门有权对违章建筑进行认定，即判断业主的建设行为是否违反了城乡规划。
• 采取措施：一旦认定为违章建筑，管理部门可以采取责令停止建设、限期改正、处以罚款、拆除等措施，以维护城乡规划的严肃性和公共利益。

三、业主应遵守的规定

• 公共绿地归属：根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，建筑区划内的绿地（除属于城镇公共绿地或明示属于个人外）属于业主共有。因此，业主无权擅自占用公共绿地建设小院。
• 合法建设程序：如果业主确实需要在小区内进行建设，应当依法取得建设工程规划许可证，并按照许可证的规定进行建设。否则，将面临被认定为违章建筑并受到相应处罚的风险。

四、建议与措施

• 业主自查：建议业主在建设前自查是否取得了相应的规划许可，并确认建设行为是否符合城乡规划的要求。
• 及时整改：如果业主已经占用了公共绿地建设小院，且未取得相应的规划许可，建议及时整改，以避免受到管理部门的处罚。
• 寻求法律帮助：如果业主对管理部门的认定或处罚有异议，可以寻求法律帮助，通过法律途径维护自己的合法权益。

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