交通肇事罪检察院不起诉并不意味着驾驶证一定不会被扣（吊销），具体是否扣证取决于交通肇事行为的具体情况、驾驶人的违法行为程度以及公安机关交通管理部门的判断。以下从不同角度进行详细分析：

一、检察院不起诉的含义

检察院对交通肇事罪犯罪嫌疑人作出不起诉决定，通常意味着不追究其刑事责任。但这并不等同于免除其他法律责任，如行政处罚责任。行政处罚与刑事责任是两种不同的法律责任，刑事责任的免除并不影响行政处罚的执行。

二、驾驶证扣（吊销）的法律依据

根据《中华人民共和国道路交通安全法》的相关规定，特别是第一百零一条，违反道路交通安全法律、法规，发生重大交通事故且构成犯罪的，将由公安机关交通管理部门吊销机动车驾驶证。这是驾驶证吊销的主要法律依据。此外，如果驾驶人存在逃逸等严重违法行为，即使未构成刑事犯罪，也可能面临驾驶证吊销的处罚。

三、检察院不起诉与驾驶证扣（吊销）的关系

1. 构成交通肇事罪但检察院不起诉的情况：

   • 即使检察院因某些原因（如犯罪情节轻微、具有从宽处罚情节等）决定不起诉，但如果交通肇事行为已经构成犯罪，公安机关交通管理部门仍有权依据《道路交通安全法》吊销驾驶证。例如，发生重大交通事故后逃逸，即使未构成刑事犯罪，也可能因严重违反道路交通安全法律、法规而面临驾驶证吊销的处罚。

2. 情节轻微或证据不足不起诉的情况：

   • 在这种情况下，检察院可能作出酌定不起诉或证据不足不起诉的决定。此时，驾驶证是否会被吊销，将取决于公安机关交通管理部门对事故具体情况和驾驶人违法行为程度的评估。如果认为驾驶人的行为仍然严重违反了道路交通安全法律、法规，驾驶证有可能被吊销。

3. 存在特殊违法行为的情况：

   • 如驾驶人存在酒驾、毒驾、逃逸等严重违法行为，这些行为本身就已经触犯了《道路交通安全法》的相关规定。无论检察院是否起诉，驾驶证都极有可能会被吊销。因为这些行为严重威胁了道路交通安全，必须予以严厉的处罚。

四、实际应用中的建议

在面对交通肇事罪检察院不起诉而驾驶证可能被扣（吊销）的情况时，建议驾驶人：

• 详细了解事故的具体情况和自身的违法行为程度；
• 积极配合公安机关交通管理部门的调查和处理，如实陈述事故经过和自身行为；
• 如有异议或认为处罚不当，可以依法申请行政复议或提起行政诉讼以维护自身权益。

总结来看，交通肇事罪检察院不起诉并不直接决定驾驶证是否扣（吊销）。具体结果需根据事故情况、驾驶人违法行为及公安机关交通管理部门的判断来确定。因此，在处理此类问题时，应综合考虑各种因素，并寻求专业法律帮助以确保自身权益得到妥善维护。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。