结论：逾期交房违约金一般不能直接从监管账户中扣除，需通过法律程序或合同约定来主张权利。

1. 监管账户的性质与用途
   监管账户是专门用于存放购房款的账户，其资金用途受到严格限制，通常只能用于项目开发建设，确保工程顺利完工并交付。根据《商品房预售资金监管办法》等相关规定，监管账户内的资金不得随意支取，必须按照工程进度和规定程序申请使用。因此，开发商不能擅自将监管账户内的资金用于支付逾期交房违约金。

2. 违约金的支付方式
   逾期交房违约金的支付通常需要通过法律程序或合同约定来实现。如果购房合同中明确约定了逾期交房的违约责任和违约金支付方式，购房者可以依据合同约定向开发商主张权利。若开发商拒绝支付，购房者可以通过诉讼或仲裁等法律途径要求开发商承担违约责任，并支付相应的违约金。

3. 特殊情况下的处理
   在极少数情况下，如果监管账户内的资金确实存在剩余，且经过相关部门批准，可能可以用于支付与项目相关的合理费用，包括因开发商违约导致的赔偿。但这种情况非常特殊，需要满足严格的法律条件和程序要求，一般情况下并不适用。

建议：如果您作为购房者遇到开发商逾期交房的情况，建议首先查阅购房合同中的相关条款，了解违约责任和违约金支付方式。如果开发商拒绝支付违约金，您可以考虑通过法律途径维护自己的合法权益。如有具体法律问题，欢迎直接向我咨询。