结论：皖能股份公司拟发行99.99亿元公司债，其募集说明书信息披露是否需要第三方审计，需结合具体披露内容及监管要求综合判断，但财务数据等关键信息通常需经审计。以下结合新闻背景及法律要求详细分析：

一、法律框架与监管要求

根据《公司债券发行与交易管理办法》及深交所相关规则，公司债券募集说明书的信息披露需满足真实性、准确性、完整性要求。其中：

1. 财务数据：募集说明书通常需披露发行人最近三年及一期的财务报告（资产负债表、利润表、现金流量表等）。根据《证券法》及证监会规定，涉及财务数据的信息披露原则上需经具有证券期货业务资格的会计师事务所审计，以确保数据可靠性。
2. 资金用途：募集资金用途（如偿还有息债务、补充流动资金、项目建设等）需明确披露，但此类信息是否需审计取决于具体表述。若涉及财务预测或承诺（如“项目建成后年收入预计XX亿元”），可能需第三方机构出具评估报告。
3. 风险因素：需披露发行人可能面临的风险（如市场风险、政策风险等），此类信息通常无需审计，但需基于客观事实分析。

二、新闻背景中的关键信息

皖能股份公司本次债券募集资金用途包括：

• 50亿元偿还有息债务；
• 9.99亿元补充流动资金；
• 20亿元用于项目建设及运营；
• 20亿元用于股权投资。

需审计的内容：

• 偿还有息债务的具体金额、债务明细（如银行贷款、债券等）需与审计后的财务报表一致；
• 补充流动资金的合理性需基于审计后的现金流数据；
• 项目建设及股权投资的预算、预期收益等若涉及财务预测，可能需第三方评估。

无需审计的内容：

• 资金用途的描述性信息（如“用于项目建设”）；
• 风险因素的定性分析（如“政策变化可能导致项目收益下降”）。

三、实务操作中的常见做法

1. 财务报告审计：根据公开信息，皖能股份公司已预披露“最近三年的财务报告和审计报告及最近一期的财务报告或会计报表”，说明其财务数据已通过审计，募集说明书中的相关内容可直接引用审计报告。
2. 专项审计或评估：若募集资金用于特定项目（如股权投资），且项目收益、估值等涉及复杂财务计算，发行人可能委托第三方机构出具专项报告，但非强制要求。
3. 承销商核查：主承销商（中信证券、中金公司）需对募集说明书内容进行核查，包括财务数据的真实性，但核查不替代审计。

四、未履行审计义务的法律后果

若募集说明书中的财务数据未经审计或存在虚假记载，可能面临：

1. 监管处罚：证监会或深交所可责令改正、暂停发行，并对发行人及相关责任人处以罚款；
2. 民事赔偿：投资者可依据《证券法》要求发行人承担赔偿责任；
3. 刑事责任：若构成欺诈发行，直接负责的主管人员和其他责任人员可能被追究刑事责任。

五、建议与启示

1. 对发行人：务必确保募集说明书中的财务数据经审计，其他关键信息（如项目预算）若涉及财务内容，建议委托第三方机构出具报告，以降低法律风险。
2. 对投资者：可重点关注募集说明书中是否披露审计报告、专项评估报告等文件，作为判断信息可靠性的依据。
3. 对行业：大型公司债发行中，财务数据审计已成为惯例，但项目收益预测等非财务信息的披露标准仍需进一步明确，以避免信息不对称。

总结：皖能股份公司本次债券募集说明书的信息披露中，财务数据需经审计，其他内容是否需审计取决于具体表述。建议发行人严格遵循监管要求，必要时委托第三方机构出具报告，以确保合规性。如有进一步疑问，可直接向我咨询。