结论：丈夫中国籍、妻子菲律宾籍，在菲律宾登记结婚的情况下，是可以在中国起诉离婚的，但具体操作需依据相关法律和实际情况进行。
一、法律背景与适用
中国法律对涉外婚姻离婚的规定：
- 根据《中华人民共和国涉外民事关系法律适用法》及相关司法解释，中国法院对涉外离婚案件有管辖权，特别是当一方为中国公民且在中国有住所时。
- 中国法律承认在外国登记的婚姻，只要该婚姻符合中国法律的基本原则和公序良俗。
菲律宾的婚姻法律制度：
- 菲律宾法律对离婚有严格限制，但允许通过婚姻无效宣告或合法分居等方式处理婚姻问题。
- 然而，这些程序在菲律宾进行可能较为复杂，且不一定能满足双方在中国离婚的需求。
二、在中国起诉离婚的途径与条件
协议离婚在中国办理：
- 如果双方均同意离婚，并且婚姻在中国被承认（即结婚手续符合中国法律），则可以在中国办理协议离婚。
- 双方需共同到一方常住户口所在地的婚姻登记机关办理离婚登记，并提交相关证明材料。
诉讼离婚在中国进行：
- 如果一方在中国居住，而另一方在菲律宾，那么在中国居住的一方可以向其住所地人民法院提起诉讼离婚。
- 法院将依据中国法律审查是否符合离婚条件，包括双方感情是否确已破裂且无法调和等。
- 诉讼过程中，法院会处理子女抚养、财产分割等问题，并作出相应裁决。
三、实际操作中的注意事项
确认婚姻在中国被承认：
- 在起诉离婚前，需确认菲律宾的结婚手续是否符合中国法律，以确保婚姻在中国被承认。
- 如果婚姻存在法律瑕疵，如未达到法定婚龄、近亲关系等，可能影响在中国起诉离婚的效力。
准备相关证据：
- 无论选择协议离婚还是诉讼离婚，都需要准备相关证据来支持自己的主张。
- 证据可能包括沟通记录、生活状态证明、财产证明等，以证明双方感情确已破裂且无法调和，或证明财产状况等。
考虑跨国婚姻的特殊性：
- 跨国婚姻的离婚问题涉及多个方面的法律规定和实际操作，情况较为复杂。
- 在处理此类问题时，建议咨询专业的国际私法或婚姻法律师，以确保整个离婚程序的合法性和有效性，并最大程度保护当事人的权益。
四、可能的法律后果与建议
法律后果：
- 如果法院判决离婚，双方将解除婚姻关系，并需按照法院裁决处理子女抚养、财产分割等问题。
- 如果婚姻存在法律瑕疵或不符合中国法律的规定，可能影响离婚的效力或导致其他法律后果。
建议：
- 在决定在中国起诉离婚前，务必咨询专业的婚姻法律师，了解具体的法律程序和要求。
- 准备充分的证据来支持自己的主张，并考虑跨国婚姻的特殊性对离婚程序的影响。
- 保持冷静和理性，妥善处理婚姻问题，避免不必要的法律纠纷和损失。
总结：丈夫中国籍、妻子菲律宾籍，在菲律宾登记结婚的情况下，是可以在中国起诉离婚的。但具体操作需依据相关法律和实际情况进行，并建议咨询专业的婚姻法律师以确保整个离婚程序的合法性和有效性。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。