与境外机构、组织、个人相勾结实施特定危害国家安全犯罪，将适用刑法第106条所规定的从重处罚情形。这具体包括以下几个罪名：

1. 分裂国家罪与煽动分裂国家罪：依据《中华人民共和国刑法（2023修正）》第一百零三条，组织、策划、实施分裂国家、破坏国家统一，或与境外勾结进行此类活动，以及煽动分裂国家、破坏国家统一的行为，若与境外机构、组织、个人相勾结，将依照法律规定从重处罚。

2. 武装叛乱、暴乱罪：根据《中华人民共和国刑法（2023修正）》第一百零四条，组织、策划、实施武装叛乱或武装暴乱，若这些行为与境外机构、组织、个人有勾结，同样会从重处罚。

3. 颠覆国家政权罪与煽动颠覆国家政权罪：依照《中华人民共和国刑法（2023修正）》第一百零五条，组织、策划、实施颠覆国家政权、推翻社会主义制度，或与境外勾结进行此类活动，以及煽动颠覆国家政权、推翻社会主义制度的行为，若与境外机构、组织、个人相勾结，也将面临从重处罚。

4. 背叛国家罪：根据《中华人民共和国刑法（2023修正）》第一百零二条，勾结外国，危害中华人民共和国主权、领土完整和安全的行为，若与境外机构、组织、个人相勾结犯此罪，将依照法律规定从重处罚。不过，此罪名虽与境外勾结有关，但并非直接由刑法第106条列出，而是因其性质属于危害国家安全犯罪，在与境外勾结时同样适用第106条的从重处罚规定。

综上所述，刑法第106条所规定的“与境外机构、组织、个人相勾结”从重的情形，适用于分裂国家罪、煽动分裂国家罪、武装叛乱暴乱罪、颠覆国家政权罪、煽动颠覆国家政权罪以及背叛国家罪等多个危害国家安全的罪名。