结论前置：一般情况下，店铺合同以本人名字签订，但营业执照办理为另外人名字的做法不符合法律规定且存在较大法律风险，不建议这样操作。以下从不同角度进行分析：

1. 合同主体与营业执照主体不一致的法律风险

• 合同效力问题：根据《民法典》相关规定，合同具有相对性，即合同的权利义务仅对签订合同的双方产生约束力。如果店铺合同是以您个人名义签订，但实际经营主体（营业执照登记人）为他人，可能导致合同主体与实际经营主体不一致。一旦发生纠纷（如租金支付、违约责任等），对方可能主张合同无效或要求实际经营人承担责任，而您可能因非实际经营人被排除在纠纷解决之外，或需承担连带责任。
• 行政处罚风险：根据《市场主体登记管理条例》，市场主体（如个体工商户、公司等）应当按照登记事项从事经营活动。如果营业执照登记人与实际经营者不一致，可能被认定为“擅自变更登记事项”或“无照经营”（如果实际经营者未办理营业执照），面临工商行政管理部门的处罚，包括罚款、责令改正甚至吊销营业执照。

2. 税务与债务责任风险

• 税务责任：营业执照登记人通常是税务登记的主体，需依法申报纳税。如果实际经营者（您）未以登记人名义纳税，可能导致登记人被追缴税款及滞纳金，甚至涉及偷税漏税的行政或刑事责任。同时，您作为实际经营者可能因未纳入税务监管而面临税务风险。
• 债务承担：如果店铺经营产生债务（如供应商货款、员工工资等），债权人可能根据营业执照登记信息追究登记人的责任。即使您与登记人之间有内部协议（如“实际经营者承担全部债务”），该协议对第三方无效，登记人仍需先对外承担责任，再向您追偿。这可能导致登记人财产受损，甚至引发您与登记人之间的纠纷。

3. 实际操作中的建议

• 方案一：变更营业执照登记人
  如果店铺实际由您经营，建议将营业执照登记人变更为您本人，确保合同主体与经营主体一致。变更流程需向工商行政管理部门提交申请，通常包括身份证明、租赁合同等材料。
• 方案二：签订内部协议并明确权责
  如果因特殊原因（如政策限制、贷款需求等）必须保持营业执照登记人为他人，您应与登记人签订详细的书面协议，明确双方权责（如经营权归属、债务承担、利润分配等），并建议办理公证以增强证据效力。但需注意，该协议仅对双方有效，无法对抗第三人。
• 方案三：重新签订合同
  如果店铺合同尚未履行或可协商变更，建议以营业执照登记人名义重新签订合同，或由您与登记人共同作为合同一方，明确各自权利义务。

总结

店铺合同与营业执照主体不一致可能引发合同效力、行政处罚、税务及债务等多方面风险。建议您根据实际情况选择上述方案之一，确保经营合法合规。如有进一步疑问，可直接向我咨询，我将为您提供更详细的法律指导。