土地承包合同纠纷和排除妨害纠纷在特定情况下是可以一并处理的。以下是对这一问题的详细分析：
一、法律关系的独立性
土地承包合同纠纷：这主要涉及土地承包合同的签订、履行、变更或解除等过程中产生的争议。例如，合同双方可能就土地承包费用、承包期限、承包土地的用途等问题产生分歧。
排除妨害纠纷：这通常指的是一方在行使土地使用权或其他物权时，受到另一方非法阻碍或干扰，从而要求排除这种妨碍的纠纷。例如，一方可能未经允许在另一方的承包地上搭建建筑物或进行其他活动。
二、一并处理的可能性
同一法律事实引发：如果土地承包合同纠纷和排除妨害纠纷是由同一法律事实引发的，例如，一方在承包地上进行非法活动，既违反了合同约定，又妨碍了另一方的正常使用，那么这两个纠纷就可以一并处理。在这种情况下，法院或仲裁机构可以综合考虑两个纠纷的事实和法律依据，作出统一的裁决或调解。
诉讼程序中的合并审理：在诉讼程序中，如果原告同时提出了土地承包合同纠纷和排除妨害纠纷的诉讼请求，且这两个请求之间存在关联，法院可以根据《民事诉讼法》的相关规定，决定合并审理。合并审理有助于提高诉讼效率，减少当事人的诉讼成本。
三、一并处理的建议
明确诉讼请求：在提起诉讼或申请仲裁时，当事人应明确自己的诉讼请求，包括土地承包合同纠纷的具体内容和排除妨害的具体要求。这有助于法院或仲裁机构准确理解当事人的诉求，并作出相应的裁决或调解。
提供充分证据：当事人应提供充分的证据来支持自己的诉讼请求。对于土地承包合同纠纷，可以提供合同文本、履行情况记录等证据；对于排除妨害纠纷，可以提供现场照片、视频资料、证人证言等证据。这些证据将有助于法院或仲裁机构查明事实，作出公正的裁决或调解。
寻求专业法律帮助：由于土地承包合同纠纷和排除妨害纠纷可能涉及复杂的法律问题和事实认定，当事人可以寻求专业律师的帮助。律师可以提供法律咨询、代理诉讼或仲裁等服务，帮助当事人更好地维护自己的合法权益。
总结来看，土地承包合同纠纷和排除妨害纠纷在特定情况下是可以一并处理的。当事人在处理这类纠纷时，应明确自己的诉讼请求，提供充分的证据，并寻求专业法律帮助。如果你有进一步的法律问题或需要更具体的法律建议，可以直接向我咨询。